바로전에 포스팅한 variant calling에 대한 것에 후속으로 somatic mutation에 대한 내용을 정리하고 있다. 살짝 귀뜸해주면 VarScan이라는 툴에 대한 논문을 보려다가 "Virmid: accurate detection of somatic mutations with sample impurity inference"라는 논문으로 급선회했고 virmid는 간단히 cancer 분석에서 contol sample이 mixed된 disease sample에 대해서 control sample이 어느정도의 proportion을 차지하는지를 estimate하여 이것을 somatuc mutation을 calling하는데 사용하는 논문이다. 뭐 그거 그렇고, 바로 snp/genotype/somtic mu..