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방명록

  • 2018.04.18 22:56 수정/삭제 댓글쓰기

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  • 2015.03.04 13:57 수정/삭제 댓글쓰기

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  • 2014.11.11 16:35 수정/삭제 댓글쓰기

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  • 2014.10.18 21:32 수정/삭제 댓글쓰기

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    • hongiiv 2014.10.21 10:27 신고 수정/삭제

      UCSC와 Ensembl은 각각 미국(NCBI)와 영국(EBI)에서 만들고 운영하는 Genome Browser입니다.

      가장 큰 차이라면 유전자 세트인데요. UCSC의 경우 RefSeq기반으로 하고 Ensembl은 그들이 gene set을 자체적으로 빌드하여 사용합니다.

      그외에도 browser의 기능에서 소소한 차이들은 많이 존재합니다.

  • 2014.06.04 14:12 수정/삭제 댓글쓰기

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    • hongiiv 2014.06.05 09:40 신고 수정/삭제

      제가 아는 바로는 특별히 유전체 데이터를 위한 javascript 라이브러리는 없구요. 기본적으로 html을 pdf로 변환하는 라이브러리와 d3 등의 라이브러리를 이용해서 구현했습니다.

      감사합니다.

  • 2014.06.04 14:12 수정/삭제 댓글쓰기

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  • 2014.04.26 01:03 수정/삭제 댓글쓰기

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    • hongiiv 2014.04.28 06:49 신고 수정/삭제

      galaxy 홈디렉토리의 tool-data 폴더를 보면 각 툴의 reference의 위치가 적혀진 .loc 파일이 있습니다. 가령 bwa의 경우 bwa_index.loc 파일을 보면 해당 reference가 위치할 폴더의 경로가 적혀 있고 직접 bwa로 index한 후 이 파일에 해당 경로를 지정해 주시면 됩니다.

    • 2014.04.28 21:25 수정/삭제

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  • Kelly 2014.04.03 11:13 신고 수정/삭제 댓글쓰기

    안녕하세요. 이 좋은 블로그를 오늘 발견했는데 이틀전에 블로그 접는다는 글이 올라와있다니요! ㅠ_ㅠ
    여기 들르시는 분들과는 약간 다른, 해외비지니스 일을 하고있는 1인 입니다.
    NGS 관련 제품을 취급하고있는데, Bio쪽으로도, Analysis쪽으로도 폭넓게 보고자 열공중입니다.
    혹시 블로그에 있는 내용들 메일로 보내주실수 있다고 하셨는데 보내주실수 있으신가요?
    그리고 BGI 발표자료 Full 로도 같이 보내주실수 있으시면 정말정말정말 감사드리겠습니다.
    again426@naver.com
    좋은 자료 공유에 감사드리며,, 정말 감사의 의미로 차 한잔 밥한끼 사드리고 싶은 심정입니다 :D

    • hongiiv 2014.04.03 13:38 신고 수정/삭제

      만우절 포스팅이었습니다. ^^;;
      해당 자료는 메일로 전달해 드렸습니다.

      감사합니다.

  • 2014.03.31 17:11 수정/삭제 댓글쓰기

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  • 2014.01.07 20:04 수정/삭제 댓글쓰기

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