NCBI 2

Bioinformatics or Computational Biology와 Web 2.0

인간의 약 30억개(base)가 되는 염기서열을 해석한다는 것은 , 30억 베이스 중에서 어느 특정부분이 어떻게 단백질로 되어서, 세포내외에서 특정 역할을 어떻게 수행하는지를 밝히는 것이다. 이러한 해석 과정을 연구하기 위한 수많은 연구 분야가 있다. 간단하게 이러한 연구를 수많은 연구를 분야를 통틀어 Bioinformatics라고 한다면, 주로 바이오 데이터를 이용한 분석보다는 이러한 분석에 대한 연구를 진행하는데에 있어 기초적인 자료를 제공하는 바이오데이터 즉, 염기서열 정보, 유전자 해석정보등을 제공하는 바이오 데이터베이스와 Web 2.0과의 결합(?), 접목(?)에 대해서 논하고자 한다. 위에서 언급한 바이오데이터는 Genome Browser 형태로 제공되는데 바이오 데이터에 대한 정보는 상당히 ..

java-programming 2007.05.10

ncbi toolkit의 ppc에서의 컴파일 문제

blast를 사용하기 위해 ncbi에서 제공하는 toolkit을 설치하다가 깜딱 놀랐다. 설치 과정중에 수행되는 스크립트가 gcc를 사용하지 않고 xlc_r을 사용하는게 아닌가?? 이 놈의 머신이 IBM PowerPC라서 머신을 체크하다가 그냥 AIX라고 생각하고 xlc_r을 ㅠㅠ;; 버그 리포트라도 해야 하나? 다시 한번 드는 생각이지만, 그냥 x86머신을 사용하는 좋단 말이지... ppc와 ppc64의 차이로 인해 이런일이 일어나다니...

Linux 2007.05.02