단맛만좋아요

생물학 분야만큼이나 공개된 데이터가 많은 과학분야가 또 있을까?? 기존에는 연구소나 정부기관들이 컨소시엄등을 구성하여 연구한 데이터를 공개하는 경우가 대부분이었다. 여기서 더불어 단지 공개만 하는것이 아니라,, 다른 연구자들이 이를 손쉽게 가져가서 사용할 수 있도록 Open API(거의 대부분이 웹서비스방식이며, DDBJ에서 REST 방식으로 최근 정보를 제공)를 제공하고 있는 추세이다. 지난 포스팅들에서 이러한 공개된 데이터를 가져다 사용하는 방법에 대해서 여러번 언급했으므로 패스,, 그런데 이러한 데이터의 공개는 이제 일반 회사에서도 이루어지고 있다. 특히나 일반 회사들이 이러한 공개를 한다는 것은 정말이지 쉽지 만은 않은 일이었을거다. Forbes지에 Biology Gose Open Source라는..

현재 국내에서 바이오인포매틱스 관련 오픈 소스 프로젝트에 직간접적으로 참여하고 계신분이 얼마나 될까요? 또한 이러한 바이오인포매틱스 관련 오픈소스의 활용은 어떠할까요?? 어떠한 부분에서 어떤 오픈 소스 소프트웨어를 사용하는지, 얼마나 알고 계신지, 필요성은 느끼시는지 궁금해지네요. Biopipe나 Bioworks도 이러한 오픈 소스가 없었더라면 생겨나지 못하는 그리고 앞으로도 오픈 소스 소프트웨어들이 받쳐 주지 않는다면 무용지물의 소프트웨어 될 수 밖에 없는 아주 중요한 문제입니다. 제가 생각하기에는 이러한 바이오인포매틱스 관련 오픈 소스의 개발과 활용에 대한 문제는 바이오인포매틱스 연구의 뿌리라고 생각합니다. 아래의 내용은 가칭 한국 오픈 바이오 사용자 모임(http://open-bio.kr)의 설립 ..

OBF에서 지원하는 BOSC(Bioinformatics Open Source Conference) 2007에서 재미난 것들을 나만 알아보도록 요약해봤다 ^^;; BOSC 2007 발표자료 1 - An Open Source Framework for Teaching Bioinformatics where's the real bottleneck in scientific computing? scientific software developement is not an oxymoron an open source software culture in the undergraduate computer science curriculum 산업현장과 학교간의 격차 오픈소스 정의 오픈소스의 가치 오픈소스 교육 프레임워크(소스코드,..