Web Collections: NGS 관련 포스팅 모음

Web Collection: 그동안 산발적으로 이루어졌던 NGS 관련한 포스팅을 한번에 볼 수 있도록 모아봤습니다. RNA-Seq에서 De novo Mutation 발굴까지 다양한 영역을 커버하고 있습니다만, 깊이는 없습니다. 곧 ChIP-Seq과 De novo RNA-Seq에 대한 부분까지 업데이트 예정입니다.

NGS 데이터 포맷 및 Alignment

• NGS 데이터의 Raw Data인 FASTQ Format에 관한 글
• Short Read Alignment에 관한 글

Variant Call

• 일반적인 Resequencing 데이터에서 Genotype and SNP Call
• Variant call software에 대한 글

Somatic Mutation

• Somatic caller 소프트웨어에 대한 글
• Low-allelic-fraction에서 Somatic Call에 관한 글
• De novo mutation에 관한 글

RNA-Seq

• 전반적인 RNA-Seq Application에 관한 글

분석 파이프라인

• 유전체 분석 파이프라인 비교에 관한 글