단맛만좋아요

돼지 독감 때문에 푹 파묻혔지만,,, 그래도 ^^;;

바로 전 포스팅에서 한국인 유전자들에 대해서 언급했었는데, 저같은 경우에는 제 실제 데이터(23andMe)가 있기 때문에 나의 실제 유전자와 논문에서 언급한 유전자를 서로 비교해 볼 수 있겠죠. 그런데 여기서 문제는 23andMe에는 논문에 나온 유전자들이 거의 포함되어 있지 않다는 겁니다. 23andMe는 Illumina칩을, 논문에서는 Affy칩을 사용해서 서로 겹치는게 별로 없습니다. ㅜㅜ;; SNPedia에서도 논문에 언급된 SNP들이 거의 없네요. 수축기 혈압관련 ATP2B1 유전자의 rs17249754 맥박에 관련된 rs12110693, rs12731740 허리/엉덩이 둘레비에 관련된 rs2074356 골강도에 관련된 rs7776725, rs1721400 체질량지수에 관련된 rs9939609 ..

Nature Genetics 온라인판에 "A large-scale genome-wide association study of Asian populations uncovers genetic factors influencing eight quantitative traits(대용량 전장 유전체 분석 - 한국인에서 8개의 정략적 정량적 표현형에 영향을 미치는 유전요인 발굴)"이라는 논문이 실렸습니다. 이번에 밝혀진 형질에는 "수축기혈압, 맥박, 허리/엉덩이 둘레비, 골강도(요골, 경골, 종골), 체질량 지수, 신장"이 포함되어 있습니다. 각 언론사에 제목을 살펴보면, 한국인 혈압.맥박에 영향주는 유전자 발굴 - 머니투데이 - 2009. 4. 27 혈압, 맥박 등 관련 유전자 세계 첫 발견- 사이언스 타임즈 - ..

어쩌다가 SNPedia를 운영하는 마이클과 연락이 되어 친구? 먹었습니다. 한국에 오라고 하니 진짜로 왔네요 ^^ 문구 그대로 입니다. SNPedia를 운영하고 있는 Michael Cariaso와 금요일 신촌에서 모임이 있습니다. 위키 & 바이오인포매틱스 & NGS(Next Generation Sequencing) & 데이터베이스 뭐든지 관심 있으신 분들은 오셔서 이야기 하셨으면 하네요... 그냥 술마시러 오셔도 됩니다. ^^;; 일시: 17일 금요일 저녁 5시~ 장소: 지하철 2호선 신촌역 3번출구로 나와서 연세대 방향으로 스타벅스 일정: 5시쯤부터 스타벅스에서 이야기를 나누다 적당한 시간에 저녁 그리고 술 꼭 5시가 아니더라도 그 후에 넉넉한 시간에 오시면 되겠습니다. 약도: http://www.fl..

View more presentations from Hong Changbum. 제가 근무하는 센터에서는 매월 첫째주 목요일마다 한국인의 유전체 연구를 하시는분들이 모여서 컨소시엄을 구성하고 회의를 하고 있습니다. 어제 저희 센터에서는 한국인 데이터를 가지고 브라우저를 만든것에 대해서 발표했습니다. 다음주쯤 공개될 예정이고, 주소는 http://ksnp.cdc.go.kr입니다. 아직 올라가 있지는 않습니다. 다음주에 공개되면 어떻게 활용할지에 대해서 이야기 해드릴께요 ^^;;

SNPedia는 위키피디아 형식으로 SNP(유전 변이의 하나)의 정보(질병과의 연관성, 신체 표현과의 연관성 등등)를 관리하고 있습니다. 이곳의 관리자분은 또한 23andMe, DecodeMe의 raw data를 입력하면 SNPedia의 정보와 결합하여 리포팅해주는 프로그램도 만들어 두었는데요, 실제 23andMe에서 분석해서 보여주는 결과보다는 부실하지만 꽤 많은 정보를 보여주고 있습니다. 여기에 제 데이터를 등록하고 그 결과도 올려놓았습니다.

오늘 23andMe(이하 23)의 분석 결과가 나왔습니다. 23의 결과는 크게 1)임상적으로 검증된?결과와 2)논문으로만 검증된 결과의 두 카테고리로 나뉘어서 1)질병에 대한 정보와 2)신체적 특징 정보로 크게 나뉘어 보여주고 있습니다. 우선 임상적인 질병정보(제 1,2형 당뇨, 노인성황반변성증, 전립선암, 파킨슨병 등등)에는 깨끗하게 아무런 이상?이 없다고 나왔습니다.

========= 2009.03.26 ========= Hong Chang-Bum: 23andMe v2, male, Korean Download 23andMe raw data More information SNPedia: http://www.snpedia.com/index.php/Genomes 23andMe: http://www.23andMe.com ========= 2009.04.22 ========= 23andme New Data!! Revision History April 9, 2009. Analysis of our data has allowed us to improve the interpretation of 10 SNPs: rs4420638, rs34276300, rs3091244, rs34601..

몇일전에 23andMe의 블로그에 파킨슨병에 대한 내용이 올라왔습니다. 일전에 구글의 창업자인 세르게이 브린이 23andMe를 통해서 자신 파킨슨병에 대한 민감도가 높다는 검사 결과와 함께 가족력도 있다고하여 한때 구글의 주가가 살짝 내려가는 소동도 있었는데,, 그걸로 끝나는게 아니었습니다. 파킨슨병 연구소와, 마이클제이폭스재단, 그리고 구글의 세리게이브린의 돈?의 도움을 받아 만명(명수는 저희 연구소와 같군요 ^^)에 대해서 25달러라는 파격적인 가격(원래는 399달러죠)으로 검사를 하고 이를 파킨슨병 연구에 쓴다고 합니다. 기본적으로 많이들 하는 GWAS를 이용한 연구가 되겠지만, 샘플을 모으는 방법이나, 그 과정이 꽤 흥미로울것 같습니다. Research 2.0 어쩌구 ^^;; 이미 23andMe에..

언젠가 쓸모가 있을듯 하여 Keynote로 작성해봤습니다. ^^ 원본은 "How Decoding Our Genetic Secrets Can Save Our Lives"입니다. "맞춤의료와 예방의학에 활용되는 유전체 해독"이라는 이름으로 한글화 해봤습니다. 도움 주신분들 감사합니다. ^^;; View more presentations from Hong Chang Bum. 출처: Google Backs Harvard Scientist's 100,000-Genome Quest (Update2) - Bloomberg