생물학 분야만큼이나 공개된 데이터가 많은 과학분야가 또 있을까?? 기존에는 연구소나 정부기관들이 컨소시엄등을 구성하여 연구한 데이터를 공개하는 경우가 대부분이었다. 여기서 더불어 단지 공개만 하는것이 아니라,, 다른 연구자들이 이를 손쉽게 가져가서 사용할 수 있도록 Open API(거의 대부분이 웹서비스방식이며, DDBJ에서 REST 방식으로 최근 정보를 제공)를 제공하고 있는 추세이다. 지난 포스팅들에서 이러한 공개된 데이터를 가져다 사용하는 방법에 대해서 여러번 언급했으므로 패스,, 그런데 이러한 데이터의 공개는 이제 일반 회사에서도 이루어지고 있다. 특히나 일반 회사들이 이러한 공개를 한다는 것은 정말이지 쉽지 만은 않은 일이었을거다. Forbes지에 Biology Gose Open Source라는..
데이터베이스에서 정보를 읽어와 그림파일(Google Map의 Tile)로 저장하는 기능은 완료된 상태이다. 이제부터는 자신이 원하는 정보를 보여주기 위한 세세한 기능들을 추가하는 기능을 하나씩 만들어 가고 있다. 여기서 잠깐 기본적으로 미흡하나마 지금까지 추가된 기능들을 하나씩 소개하는 시간을 가지도록 하겠다. ^^ 주메뉴 살펴보기 주메뉴의 모습 View Data by Chromosome Genome Browser는 chromosome 하나씩 보여줄 수 있기 때문에 자신이 원하는 chromosome을 Select Box를 통해서 선택할 수 있다. 또한 자신이 원하는 chromosome의 특정 영역으로 빠르게 소환(?)할 수 있도록 [genome-wide view]를 선택하면 아래 그림과 같은 창이 뜨고 ..
만들어봐야겠다라고 생각하고 시작한지로부터 이제 거의 3주가 다 되어가네요 ^^;; 우선 오늘 추가된 부분은 제 블로그의 왼쪽 상단에 PAGES 부분에 Genome Browser Dev라는 링크를 만들었구요, Browser의 정보를 보여주는 왼쪽 상단의 붉은 박스의 내용을 좀 수정했습니다. 기본적으로 CSS에서 맑은 고딕 폰트를 보여주도록 바꾸었습니다. 줌인과 아웃시에 enableContinuousZoom() 메소드를 추가해서 부드럽게 줌 인/아웃이 되도록 했습니다. 현재 보여주는 정보는 1번 Chromosome의 첫부분 약 400,000bp 정도이며, CNV 정보를 보여주고 있습니다. 해당 CNV 정보는 Database of Genomic Variants의 정보를 기반으로 하고 있습니다. 이상!!!!