단맛만좋아요

민간 우주 여행, 로봇의 달탐사, 10일 안에 100명의 Genome 염기서열 분석 모두 꿈 같은 이야기이지만, 그 꿈같은 이야기들이 X PRIZE 재단에 의해서 커다란 상금을 걸고 진행중이거나 이미 끝난 대회이다. 2006년 개인의 맞춤형 의료 서비스의 진입을 위하여 X PRIZE에서는 민간에서 10일 안에 100명의 Genome을 해석할 수 있다면, 그것도 Genome 당 $10,000 이상의 비용이 들어가지 않도록 해낸다면, $1,000만 우승 상금을 얻게 된다. 이것이 바로 Archon X PRIZE for Genomics 이다. 그럼 이러한 일을 가능하게 하는데 중요한 역할을 하는 것이 무엇일까? 바로 Grid 컴퓨팅이나 클러스터 컴퓨팅의 Job Scheduler, DRM(Distributed ..

사단법인 분자설계연구소(연세대학교내)에서 "Virtual Laboratory based on GRID Technology workshop"에 다녀왔습니다. 아침에 7720번 버스를 타고 연세대학교로 향하는 길은 출근을 하지 않는다는 것만으로도 ㅋㅋㅋ^^ 더 잊기전에 기억에 남는 세션만 간략하게 정리해봅니다. 미투데이에 간략하게 남기다가,, 인터넷 사정이 별로 좋지 않아서 그만두고 메모 남기기를 포기했습니다. ㅋㄷㅋㄷ Large Scale Computing for Bioinformatics Yutaka Akiyama, Tokyo Institute of Technology, Japan 기억에 남는건 GPU(graphics processing unit)에 SSD까지 이용해서 클러스터를 구축해서 높은 성능 향상..

생명 과학 분야에서 그리드를 이용한(e-Science라고 불러도 되겠죠 ^_^) 본격적인 응용이 개발되고 있습니다. 이전까지 기반 기술에 대한 연구가 어느 정도 된 상태이기 때문에 이젠 본격적으로 이러한 그리드 기반 기술을 이용한 다양한 응용이 이루어지는 원년이라고 봐도 될것같습니다. 이제 몇년 후에는 신기술이 아니라, 우리가 인터넷으로 메일을 보내는 것처럼 자신의 분야에 맞는 그리드를 이용한 연구가 자연스러워질 거라고 확신하고 있습니다. 지금까지 제가 알아 본 생명 과학 분야의 그리드 응용은 다음과 같습니다. KISTI의 e-Science 사업단(http://escience.or.kr/ , 단장 변옥환)의 응용연구팀에서 "BT/NT분야 응용연구"를 수행 중 대전 한국정보통신대학교의 ITRC Grid M..

myExperiment에 대한 내용이 들어있는 ppt자료네요 ^^;; Web2.0과 어떠한 형태로 Grid와 함께 e-Science를 만드는지에 대한 내용과 Web2.0에서의 myExperiment에 대한 내용이 들어있습니다. 이 자료 하나로 현재의 e-Science를 전망해 볼 수 있을거 같습니다. | View | Upload your own

외국에서는 distributed computational environment 즉, grid나 cluster 환경과 자신의 연구분야에 어떻게 적용하고 어떠한 서비스를 할것인지에 대해 오래전부터 꾸준하게 연구가 진행되고 있다. Bioinformatics, Immunoiformatics등 bio~분야도 예외가 아니다. 앞서 언급했었던 biomoby, biogrid, taverna, bioclipse 등이 그 활용 분야의 대표적인 예라고 할 수 있겠다. 그럼 분산 컴퓨팅환경에서 blast를 수행하고 이를 웹 서비스를 통해서 제공한다면, 이미 많은 곳에서(일본의 XML Central of DDBJ, 유럽의 EBI에서 제공하고 있다.) 서비스를 제공하고 있지만, 나도 한번 해보자는 의미에서 차근차근 공부해 나가고..