단맛만좋아요

UCSC Genome Browser는 HGP를 가져갔고, GBrowser는 HapMap을 가져갔고, Ensemble은 1000 Genome을 가져갔다. 그동안 Ensembl이 제일 불쌍했었는데, 들리는 소문에 의하면 Ensemble은 전세계를 투어하면서 자신들의 Browser를 활용하는 방법에 대해서 강연도 해준다고 한다. 이로써 셋이 나란히 한 프로젝트씩 나눠가졌다. 개인적으로는 GBrowser가 제일 좋은듯,,,^^;; HapMap with GBrowser 1000 Genomes with Ensembl

4대 지놈 브라우저(Genome Browser) UCSC, Ensembl, NCBI MapView, Gbrowse에 대한 소개 및 특히 Gbrowser에 대한 내용입니다. DAS를 통한 분산 주석 처리와 Genome의 특정 Region의 빠른 검색을 위한 R-Tree 알고리즘과 그 성능에 대한 간단한 자료입니다. 별 내용은 없음,,,(가끔 오타도 있는데 수정하기가,, ^^;;) View SlideShare presentation or Upload your own. (tags: ucsc ncbi)

인간의 약 30억개(base)가 되는 염기서열을 해석한다는 것은 , 30억 베이스 중에서 어느 특정부분이 어떻게 단백질로 되어서, 세포내외에서 특정 역할을 어떻게 수행하는지를 밝히는 것이다. 이러한 해석 과정을 연구하기 위한 수많은 연구 분야가 있다. 간단하게 이러한 연구를 수많은 연구를 분야를 통틀어 Bioinformatics라고 한다면, 주로 바이오 데이터를 이용한 분석보다는 이러한 분석에 대한 연구를 진행하는데에 있어 기초적인 자료를 제공하는 바이오데이터 즉, 염기서열 정보, 유전자 해석정보등을 제공하는 바이오 데이터베이스와 Web 2.0과의 결합(?), 접목(?)에 대해서 논하고자 한다. 위에서 언급한 바이오데이터는 Genome Browser 형태로 제공되는데 바이오 데이터에 대한 정보는 상당히 ..