오픈소스 3

다시 한번 되짚어 보는 오픈소스 라이선스

많은 사람들의 입에서 회자되고 있는 오픈소스, 잘 알고 사용하고 있는것인가? 특히 생물정보학 분야에서는 많은 오픈소스 및 논문에서 언급되는 소프트웨어들을 사용하고 있다. 이러한 각각의 소프트웨어들은 오픈소스 라이선스를 따르는 것도 있고 고유의 라이선스 정책을 취하고 있는것들도 있다. 여기서 우리가 흔히 보는 오픈소스 라이선스 중 GPL, LGPL, BSD 라이선스에 대해서 짧게 살펴 보기로 한다. 배포시 수정된 코드의 소스 공개의 의무: GPL, LGPL 내가 GPL이나 LGPL의 라이선스를 가지는 오픈소스를 수정해서 프로그램을 만들었다면 당연 그 프로그램의 소스는 공개해야만 한다. 사용소프트웨어와 같이 사용가능한가? LGPL, BSD GPL 라이선스의 경우에는 사용소프트웨어와 서로 결합하여 사용할 수 ..

blogging 2008.07.31

OpenSource로 생물정보학 분석 도구(시스템) 개발하기 - Ohloh.net

생물정보학을 통해서 어떠한 분석이나, 분석을 시스템을 만드는 경우 우리는 오픈소스로 소프트웨어를 활용게 된다. 마이크로어레이 분석 시스템이나, genome 브라우저 등을 만들때도 있고 아니면 비교적 스크립트 몇줄로 이루어진 분석 도구를 만들때도 있다. 이런 경우 무턱대고 처음부터 끝까지 자신이 직접 코드를 작성하진 않을 것이다. 자신이 원하는 기능을 같은 라이브러리(Bioperl, Biojava, Biopyton)나 소프트웨어(R-project, svm light, ensembl, blast)등을 이용할 것이다. 이러한 작업에 있어서 우선 처음으로 생각해봐야 할것은 어떠한 오픈소스라이브러리나 소프트웨어를 사용하는가 이다. 나에게 필요한 오픈소스 소프트웨어가 무엇인지를 찾아보는 Ohloh.net의 Stac..

Bioblogs 2008.01.23

국내 바이오인포매틱스 관련 오픈 소스 현황

현재 국내에서 바이오인포매틱스 관련 오픈 소스 프로젝트에 직간접적으로 참여하고 계신분이 얼마나 될까요? 또한 이러한 바이오인포매틱스 관련 오픈소스의 활용은 어떠할까요?? 어떠한 부분에서 어떤 오픈 소스 소프트웨어를 사용하는지, 얼마나 알고 계신지, 필요성은 느끼시는지 궁금해지네요. Biopipe나 Bioworks도 이러한 오픈 소스가 없었더라면 생겨나지 못하는 그리고 앞으로도 오픈 소스 소프트웨어들이 받쳐 주지 않는다면 무용지물의 소프트웨어 될 수 밖에 없는 아주 중요한 문제입니다. 제가 생각하기에는 이러한 바이오인포매틱스 관련 오픈 소스의 개발과 활용에 대한 문제는 바이오인포매틱스 연구의 뿌리라고 생각합니다. 아래의 내용은 가칭 한국 오픈 바이오 사용자 모임(http://open-bio.kr)의 설립 ..

Bioblogs 2007.12.28