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Compile (2)
R-package 컴파일 하기

모든 생물정보학을 하시는 분들의 제일 첫 질문은 R 설치되어 있습니까? 라는 질문이다. 가장 많이들 사용하시는 프로그램(?) 중 하나인데, 일반 X86에서는 문제가 없지만, Intel Itanium2나 IBM PowerPC의 64bit machine에서는 잘 컴파일된 것 같지만, 막상 테스트를 해보면 어이없게도 에러가 발생하곤 한다. PPC64에서 rnorm(10^9)을 계산해보면 바로 메모리 관련 에러를 뱉으면서 계산하기 싫다는 에러를 내곤 계산을 포기하는 현상이 발생해 버렸다(cannot allocate vector length XXXXXKB). 여태 모르고 있었다니..ㅜㅜ 음~ 역시 구글링을 통해 R 메일링 리스트를 검색해보니 답이 나와 있더군요 ^^ It has been reported that ..

R 2007. 12. 6. 18:00
ncbi toolkit의 ppc에서의 컴파일 문제

blast를 사용하기 위해 ncbi에서 제공하는 toolkit을 설치하다가 깜딱 놀랐다. 설치 과정중에 수행되는 스크립트가 gcc를 사용하지 않고 xlc_r을 사용하는게 아닌가?? 이 놈의 머신이 IBM PowerPC라서 머신을 체크하다가 그냥 AIX라고 생각하고 xlc_r을 ㅠㅠ;; 버그 리포트라도 해야 하나? 다시 한번 드는 생각이지만, 그냥 x86머신을 사용하는 좋단 말이지... ppc와 ppc64의 차이로 인해 이런일이 일어나다니...

Linux 2007. 5. 2. 15:25
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