Genomics & Cloud (1) - Galaxy를 이용한 SNP 분석
오늘은 클라우드 컴퓨팅과 지노믹스 첫 번째 시간으로 Galaxy라는 웹 기반의 Genomic 데이터 분석 툴을 가지고 SNP 분석에 대해서 알아본 후 두 번째 시간에는 아마존의 EC2 서비스를 통해서 Galaxy를 아마존에 EC2 클러스터에서 사용하는 방법에 대해서 알아보겠습니다. 우선 Galaxy (스마트폰 아님 -.-;;)에서는 많은 기능을 제공하고 있는데 여기서는 SNP 데이터를 기반으로 작업하도록 하겠습니다. 오늘 분석은 Exon 상에 존재하는 이미 알려진 SNP을 찾아내고 많은 수의 SNP 을 가지고 있는 Exon 순으로 소팅하도록 하겠습니다. Galaxy를 통해서 UCSC의 Exon 데이터 가져오기 UCSC Browser는 브라우저상에 보여지는 내용을 Galaxy로 내보내는 기능 (UCSC T..
유전자정보분석
2010. 12. 7. 21:57
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