본문 바로가기

KISTI8

Serial 작업을 위한 MPI 래퍼 프로그램 KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 tachyon의 경우 사용자당 10개의 job만 제출할 수 있다. 따라서 실행할 작업이 시리얼한 작업일 경우 한번에 10개 이상의 노드를 사용하기 위해서는 아래와 같이 MPI 코드로 래퍼를 만들어서 실행하면 원하는 갯수 만큼의 시리얼 작업을 한번에 수행할 수 있다. script_0.sh ~ script_N.sh의 스크립트를 미리 만들어 놓은 후 실행 스크립트에서 #$ -pe mpi_fu N으로 지정하면 N개의 스크립트를 하나의 qsub로 해결~!! =====mpi_wrapper.c===== #include "mpi.h" #include #include int main( int argc, char *argv[]) { int done = 0, n, myid, numprocs, i;.. 2009. 1. 28.
Bioworks 사용후기, 시나리오 이벤트 제출 자료 KISTI의 Bioworks 이벤트시 제출했던 사용후기와 시나리오 입니다. 이걸 공개해도 되는건지는 모르겠지만, 지금의 상황에서는 KISTI 측에서 그냥 단지 이벤트를 위한 도구일뿐 이를 활용할 계획은 없는것처럼 보이네요 ^^;; 뭐 문제가 된다면 연락이 오겠죠. 나중에라도 제가 볼 수 있게 이렇게 블로그에 포스팅합니다. Bioworks 사용후기 Bioworks 시나리오 내용은 뭐 공개하기에 부끄럽습니다만,, 그냥 그려려니 하세요 (^_______^)/ 2008. 1. 23.
역시 일회성 이벤트인건가?? 지난 20일부터 계속 스팸성 글들을 게시판에 올라오는데 아무도 관리를 하지 않는군요 ^^;; 이제 시나리오공모도 끝나고 모든 이벤트가 마감되니 더이상 관리하지 않나 봅니다. 어째 이거 일회성 이벤트가 아닌가? 게시판에 쓴 글처럼 과연 몇년을 걸쳐서 다듬어갈 의지가 있는건지 한번 생각해보게 됩니다. ㅜㅜ 누구 KISTI에 연락이 되시는 분은 좀 지우라고 좀 전해주세요~~ 2007. 12. 26.
Bioworks야 힘내자!! 목요일과 금요일 이틀간 연찬회에 참석하느라 안면도에 내려가 있어서 인터넷에 접속을 못했는데 이제야 인터넷을 ㅠㅠ 제가 수요일날 Bioworks QnA에 글을 하나 썼는데 아무래도 마음에 걸려서 ^^;;. 이글을 쓸 당시에는 빨리 사용해보고 후기를 작성해야겠다는 급한 마음으로(주말에는 좀 놀려구 ^^;;) Bioworks를 실행하고 사용하다가 로그인에서부터 기존에 작성하던 User Data의 폴더에 있는 workflow와 data에 접근 하려다가 너무 오랜 시간과 시스템이 다운되는 상황이 되다보니 제가 좀 격해 있었습니다.(ㅎㅎ 계속 그랬었지만...) ^ㅇ^/ 개선할 부분이나 추가해야 할 부분이 많지만, 욕을 먹더라도 사용자들의 의견을 수용하여 제대로 만들어 보겠다는 일념으로 오픈하셨다는것을 알고는있었지만.. 2007. 11. 23.