PubMed 3

PubMed에 재미를 주자 - 논문 저자들의 네트워크를 한눈에 K-Bio Author Net

우리나라 사람들은 모두 몇 다리만 거치면 다 아는 사이라고 하죠,,, 뭐 세상 참 좁다라는 말도 곧잘 하곤 합니다. 여기 KISTI에서 PubMed를 기반으로 국내 연구자들의 논문의 공동저자 네트워크를 만들어 주는 서비스가 있습니다. 바로 K-BioMed Authors Net입니다. 저자명으로 검색하거나 기타 여러가지 방법으로 저자를 선택하면 해당 저자와 함께 논문을 쓴 공동 저자들이 네트워크 형태로 나타나고 다른 저자를 클릭하면 또 그와 함께 한 공동저자의 목록이 나오게 됩니다. 뭐 몇번만 이렇게 클릭하다가는 우리나라 연구자 전체가 다 나올지도,,,, 소속기관을 국립보건연구원 Korea National Institute of Health로 하고 저자를 Dong-Joon Kim으로 했을때 결과입니다. 참..

blogging 2008.12.11

PubMed 검색결과를 impact factor 값으로 정렬해서 보기

어제 PubMed의 검색 결과로 나온 논문을 클릭하면 유사논문 찾기 서비스에 대해서 잠깐 언급했는데, 오늘은 PubMed의 검색결과를 impact factor 순으로 정렬해서 보여주는 것에 대해서 이야기 해보려고 한다. BioBlogRSS에 자주 등장하는 YOKOFAKUN 블로그의 Pubmed, impact factors, sorting and FriendFeed 글에서 나온 이야기이다. 여기에서 우선 jar 파일을 다운로드한 후, PubMed의 검색결과를 XML 형태로 저장한다. Display 형태를 XML로 하고 File을 선택하면 XML 형태의 pubmed_result.txt 라는 검색결과 파일을 얻을 수 있다. 그럼 준비된 jar 파일을 PubMed검색결과 파일을 입력으로 주고 실행하면 sort된..

Bioblogs 2008.06.11

Biomedical계의 PageRank ^^

PageRank without hyperlinks: reranking with PubMed related article networks for biomedical text retrieval BMC Bioinformatics에 나온 논문인데,, 간단하게 Google의 PageRank가 웹페이지의 특성인 hyperlink를 통해서 점수를 주는건데,, 이 논문에서는 이러한 PageRank에서의 hyperlink 대신에 논문의 인용(citation)을 이용한다는 것이다. 음 꽤 그럴싸한데,, 근데 원래 그러던거 아니였던건가보네 ^^;; 뭐 이쪽에는 별 관심이 없었던 터라. 자세히 읽어보지는 않았지만,,, 그냥 PubMed에서 검색 결과와 함께 오른쪽에 보여주던 Related Articles가 오늘 따라 예사롭게..

blogging 2008.06.10