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Genomics & Cloud (2) - Galaxy를 이용한 부시맨 Genome 분석

Genomeics & Cloud의 두 번째 시간이 왔습니다. 바로 클라우드 컴퓨팅쪽으로 가려고 했지만 galaxy를 이용한 genome 분석에 대해서 하나만 더 이야기 하고 Amazon의 클라우드로 넘어가려고 합니다. 저번 시간에는 기본적인 galaxy의 사용에 초점을 맞추어 진행했는데 오늘도 저번과 galaxy의 기능에서는 추가되는 내용은 없지만 실제 아프리카의 부시맨 데이터를 가지고 진행을 하도록 하겠습니다. - 마찬가지로 galaxy 홈페이지에 Screencast에 있는 내용입니다. 1980년 개봉된 영화 부시맨, 주인공 니카우씨는 2003년 07월 돌아가셨네요. 이번 분석에 사용된 부시맨들은 니카우씨 연배의 분들입니다. 아프리카 남부의 부시맨 올해초 아프리카 남부의 부시맨(Khoisan, 코이산종..

Cloud Based Bioinformatics 공공에서 해야하는건가?

일전에 'Big Data 어제 오늘 이야기는 아니지만'이라는 글에서 네이처에 나온 대용량 데이터에 대한 글을 소개한적이 있다. 이번에는 'Data for the masses'라는 글이 올라왔다. 아마존에서는 이미 공공의 거대 데이터(생물학, 화학 등)를 아마존 웹서비스를 통해 사용할 수 있도록 해주고 있다. 이러한것이 공공에서 이루어져야 하는지 아마존과 같은 회사에서 이루어져야 하는것인지 한번 생각해 보게 하는 글이다. 이제 어렵게 GeneBank를 돌아다닐 필요없이 필요한 양 만큼의 스토리지와 컴퓨팅 파워를 아마존에서 구입한 후 바로 GeneBank 데이터를 Hadoop을 이용해서 ^^;; 점점 Cloud Based Bioinformatics가 - 트위터에서 이 주제로 발표한 내용이 있다고 들었는데,,..

blogging 2009.01.14