bioclipse 2

Bioclipse: an open source workbench for chemo-and bioinformatics

Bioclipse: an open source workbench for chemo-and bioinformatics 요약 Background: 화학-바이오인포매틱스(chemo- and bioinformatics) 연구에 필요한 단일의 워크벤치(singel workbench)로부터 소프트웨어 어플리케이션이 필요하다. 상업 패키지(commercial packages)의 경우 비용과 소스의 비공개(closed source) 문제가 있다. 따라서 알고리즘을 교체(modify algorithms)하거나 기능(custom functionality)을 추가하는데 문제가 있다. 본 오픈소스 프로젝트(existing open source projects)는 사용하기 쉬운 인터페이스(user-friendly) 보다 독립되..

Bioblogs 2007.07.27

Eclipse Rich Client Platform(RCP)를 이용한 Bioclipse

Bioclipse: an open source workbench for chemo- and bioinformatics, Ola Spjuth1, 2007, BMC Bioinformatics. 다들 알고 있겠지만 Eclipse는 단지 자바나 기타 프로그래밍 언어를 위한 통합개발환경(IDE)이 아니라, 툴의 통합을 위한 공개 플랫폼이다. 다시 말해서 Eclipse는 상이한 툴들이 끊김없는 유저 인터페이스를 가진 단일 통합 어플리케이션으로 합치기 위한 프레임워크를 제공한다. Eclipse RCP는 Eclipse가 단순히 개발툴인 아닌 어플리케이션 플랫폼으로 활용할 수 있도록 정의된 것으로 Eclipse는 SWT를 기반으로 GUI 플랫폼의 독립성을 확보하고, 그 위에 수많은 플러그인이 합쳐진 결과가 Eclipse..

Bioblogs 2007.07.27