바이오인포매틱스 웹서비스 살펴보기 - EMBL-EBI 서비스
바이오인포매틱스와 웹 서비스 분자생물학이나 바이오인포매틱스와 관련한 도구들이나 데이터베이스에 대한 웹 서비스는 꾸준히 늘어가고 있다. 대표적인 곳으로는 영국의 EMBL-EBI, 미국의 NCBI, 일본의 DDBJ와 PDBJ가 있으며, 그 외에도 연구소나 프로젝트별로 다양한 웹 서비스를 제공하고 있다. 주요 데이터 센터 EMBL-EBI, Cambridge, 영국 (http://www.ebi.ac.uk/Tools/webservices)NCBI, 미국 (http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query/static/esoap_help.html)DDBJ, 일본 (http://xml.nig.ac.jp/index.html)PDBJ, 일본 (http://pdbj.protein.osaka-u..
Blast Web Service를 제공하는 DDBJ, EBI와 내가 만든 Blast의 총 3개에 대하여 blastp, swissprot 데이터베이스, 서열(>gi|2501594|sp|Q57997|Y577_METJA PROTEIN MJ0577)에 대해서 Blast를 수행한 결과입니다. 결과는 당연히 똑같아야 하겠지만, Blast의 버전이 제가 2.2.14 버전으로 좀 낮고 swissprot데이터베이스는 DDBJ가 좀 틀리네요 ^^ 각각의 Blast 결과를 보시려면 more를 클릭하세요^^;; ========================================== ===========DDBJ BLAST with SWISS Prot=========== =============================..