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ucsc (2)
4대 Genome Browser에 대한 설명

4대 지놈 브라우저(Genome Browser) UCSC, Ensembl, NCBI MapView, Gbrowse에 대한 소개 및 특히 Gbrowser에 대한 내용입니다. DAS를 통한 분산 주석 처리와 Genome의 특정 Region의 빠른 검색을 위한 R-Tree 알고리즘과 그 성능에 대한 간단한 자료입니다. 별 내용은 없음,,,(가끔 오타도 있는데 수정하기가,, ^^;;) View SlideShare presentation or Upload your own. (tags: ucsc ncbi)

blogging 2008. 11. 6. 17:29
UCSC의 DBSNP 데이터를 단 2줄로 내 컴퓨터로 가져오기

Pierre Lindenbaum(Blog : YOKOFAKUN) 이 분은 프랑스분이신거 같은데 프로필에 보면 바이러스학을 전공하시는걸로 되어있는데,,, Nature Network의 Bioinformatics그룹이나 MyExperiment에서 봤던(?)분이다. 이것저것 참 재미있는 내용이 많은 블로그이고, BioBlogRSS에도 등록되어 구독되고 있는 바로 그 블로그인데,, 여기의 My fNotebook: Apache Tomcat / Bioinformatics의 글에서 누구나가 쉽게 리눅스에서 웹서버를 설치하고 활용하는 방법에 대해서 적어 주셨다. 이 글에서 UCSC의 dbsnp를 가져오는 부분만 발췌해서 보면 다음과 같다. 1. snp 정보가 들어갈 데이터베이스를 생성한다. mysql -u root -p..

howto 2008. 3. 3. 11:37
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