Fork me on GitHub 단맛만좋아요 :: personal genomic 관련 프로그램과 웹사이트

personal genomic 관련 프로그램과 웹사이트
2011.01.18 13:38 | 개인유전체분석
SNPedia/Web page: 위키 기반으로 SNP과 연관된 trait(질병포함) 정보를 제공하고 있으며, 여러 사람들의 협업을 통해 자료가 업데이트되고 있지만, 주로 관리자가 NCBI의 rss 데이터를 주기적으로 받아 정리하고 있다.

SNPTips - SNPedia

Promethease/Mac, Windows program: 자유롭게 다운로드 받아 사용할 수 있으며, 23andMe, deCODEme, Navigenics의 raw data를 넣으면 SNPedia로 부터 데이터를 가져와 SNP과 trait 정보를 보여준다.

promethease

DIYgenomics/iPhone, Android app: 20여가지의 SNP과 관련된 trait 정보를 보여주는데, 23andMe, deCODEme, Navigenics에서 각각 trait에 사용된 SNP을 비교해서 볼 수 있도록 해준다.

DIYgenomics

DIYgenomics

SNPtips/FireFox extension: FireFox의 확장기능으로 자신의 23andMe raw data를 입력해주면 웹페이지에서 rs로 시작하는 SNP문자열에 클릭할 수 있는 버튼이 생기며 해당 SNP에 대한 자신의 정보와 함께 외부 사이트로의 링크를 제공한다.

SNPTips


SNPTips

Enlis/Mac, Windows program: Promethase와 마찬가지로 23andMe의 raw data를 입력하면 해당 사용자의 정보를 분석해서 보여준다. 아직까지 특정 trait에 대한 정보는 없으며 전체적인 SNP에 대한 통계 정보를 보여준다.

Enlis

Enlis


Ensembl and UCSC/Genome Browser: 유전자 및 유전변이와 그에 관련한 phenotype 정보를 볼 수 있는 가가장 대중적인 genome browser이다.

Catalogue of genome-wide association studies/Web page: National Human Genome Research Institute에서 제공하는 현재까지 SNP과 관련한 GWAS 연구 결과를 보여준다.
저작자 표시 비영리 동일 조건 변경 허락
신고
Software enginner of GenomeCloud. Covers bioinformatics, computational biology, and life science informatics.
Posted in : 개인유전체분석 at 2011.01.18 13:38
Currently 댓글이 없습니다. comments want to say something now?

티스토리 툴바