personal genomic 관련 프로그램과 웹사이트

SNPedia/Web page: 위키 기반으로 SNP과 연관된 trait(질병포함) 정보를 제공하고 있으며, 여러 사람들의 협업을 통해 자료가 업데이트되고 있지만, 주로 관리자가 NCBI의 rss 데이터를 주기적으로 받아 정리하고 있다.

Promethease/Mac, Windows program: 자유롭게 다운로드 받아 사용할 수 있으며, 23andMe, deCODEme, Navigenics의 raw data를 넣으면 SNPedia로 부터 데이터를 가져와 SNP과 trait 정보를 보여준다.

DIYgenomics/iPhone, Android app: 20여가지의 SNP과 관련된 trait 정보를 보여주는데, 23andMe, deCODEme, Navigenics에서 각각 trait에 사용된 SNP을 비교해서 볼 수 있도록 해준다.

SNPtips/FireFox extension: FireFox의 확장기능으로 자신의 23andMe raw data를 입력해주면 웹페이지에서 rs로 시작하는 SNP문자열에 클릭할 수 있는 버튼이 생기며 해당 SNP에 대한 자신의 정보와 함께 외부 사이트로의 링크를 제공한다.

Enlis/Mac, Windows program: Promethase와 마찬가지로 23andMe의 raw data를 입력하면 해당 사용자의 정보를 분석해서 보여준다. 아직까지 특정 trait에 대한 정보는 없으며 전체적인 SNP에 대한 통계 정보를 보여준다.

Ensembl and UCSC/Genome Browser: 유전자 및 유전변이와 그에 관련한 phenotype 정보를 볼 수 있는 가가장 대중적인 genome browser이다.

Catalogue of genome-wide association studies/Web page: National Human Genome Research Institute에서 제공하는 현재까지 SNP과 관련한 GWAS 연구 결과를 보여준다.