BioWorks와 Biopipe가 생각 나는 서비스

예전에 Biopipe와 Bioworks라는 workflow management system이 있었다는 걸 기억하는 사람이 있을까? 아! 아직 KISTI의 Bioworks는 개발중에 있고 다양한 분석을 지원할거라고 예전에 댓글에서 본 적이 있다. 아마 KISTI의 Bioworks는 지금 소개할 서비스를 보고 좀 분발해야 하지 않을까 한다. NGS 분석에 있어서 DNAnexus나 BGI의 EasyGenomics들과는 좀 차별화된 서비스인 Seven Bridge Genomics가 오늘의 주인공이다. SBG의 IGOR이라는 서비스는 간단하게 데이터를 업로드하고 자신이 직접 파이프라인을 설정하면 끝나게 되는 서비스이다. 백문이불여일견이라 했던가 스샷 몇개 첨부로 오늘은 끝!!!


데이터 업로드 전용툴 
대용량의 NGS 데이터를 위해서는 이제는 필수적인 손쉽게 사용 가능한 데이터 업로드 전용 툴, 이름도 귀요미 스타일로 CloudSync로 Java 기반의 화려한? UI를 자랑한다.

 

파이프라인 제작
 이제 다양한 NGS 관련 소프트웨어들의 입/출력을 고려해서 쓱싹 파이프라인을 만들어 주고 실행하면 분석이 스르륵.... 아래는 일반적인 BWA를 이용하여  align하여 bam 파일을 얻는 일련의 과정에 대한 파이프라인을 구성한것, Variant calling, BAM/SAM 밤샘,, 밤 안샘..!!! processing, fastq processing 등 다양한 ngs 분석 관련 툴들을 마우스를 끌어다 놓으면 되며, 여기에 기본적으로 포함되지 않은 툴들은 당근 App 형태로 만들어 제공할 수 있다. 요것도 요즘 트렌트 앱장터... 나도 숏다리 얼라인 대빵 잘하는 프로그램 하나 맹글고 논문도 쓰고 앱도 만들어 팔고 하면..ㅋㅋㅋ 

 

자 결론은 뭐냐면,,, 분발해서 열심히 하자는 거지뭐~~ 근데 버그 리포팅하면 S모사도 그렇구 여기도 그렇구 지네들 분석에 사용할 수 있는 캐쉬를 준다. 누굴 그지로 보나... 그딴거 안줘도 된단 말이지 -________-