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국내에도 상당한 숫자의 기기가 퍼진걸로 알고 있는데, 얼마전 중국의 BGI도 왕창 구매한 시퀀싱의 민주화를 이끌고 있는 기기입니다. 네 LT의 IonTorrent입니다. IonTorrent는 기본 Torrent Suit라는게 분석을 해주는데, 여기서 부족한 것은 API를 이용하여 플러그인 형태로 개발이 가능합니다.

가령 이런것들이 되겠죠.

Case 1) 여러대의 장비에서 별도로 생산된 read 데이터들을 한번에 분석한다거나 
Case 2) 별도 내부의  유전체 등의 DB와 연동되어 specific한 결과를 생성한다거나
Case 3) 별도의 자체 제작된 알고리즘(RNA-Seq, ChIP-Seq 등등)을 이용 한다거나
Case 4) 암/신생아와 같은 clinical 한 리포트를 생성한다거나, BRCA 유전자 리포트를 자동 생성한다거나...등등등
Case 5) 결과를  user들에게 자동으로 배포한다거나
Case 6) human-identification을 위해 사용하는 경우 자체 범죄자 DB와 시퀀싱 후 바로 연동되어 범인을 식별한다거나
Case 7) 23andMe와 같은 gwas결과와 결합하여 risk prediction 리포트를 생성한다거나
Case 8) 결과 데이터를 시각화하는 부분
Case 9) 고객 DB와 연동되어 고객별 결과 출력 및 전송
Case 10) 데이터를 별도로 백업 


뭐 암튼 이런것들을 하고 싶으시다 하시는 분들은... 물론 장비가 이미 있거나 구매하려고 계획하시는분들이 해당되겠죠. 아니면 정말 denovo나 ChIP-Seq 등 좋은 알고리즘을 개발하신 분이나 사업상 commercial하게 플러그인을 통해 $벌고 싶으신분 환영합니다. 플러그인 공짜로 만들어 드리겠습니다.

연락주세요 ^^;;
 
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