Bioinformatics와 Open Source

OBF에서 지원하는 BOSC(Bioinformatics Open Source Conference) 2007에서 재미난 것들을 나만 알아보도록 요약해봤다 ^^;;

BOSC 2007 발표자료 1 - An Open Source Framework for Teaching Bioinformatics

where's the real bottleneck in scientific computing?
scientific software developement is not an oxymoron
an open source software culture in the undergraduate computer science curriculum

산업현장과 학교간의 격차
오픈소스 정의
오픈소스의 가치
오픈소스 교육 프레임워크(소스코드, 품질 및 커뮤니티)
courseforge(하드웨어 + 소프트웨어 인프라스트럭처)

학과정중에 오픈소스 적용한 프로젝트 수행- 방학중에 집중적으로, 한명의 메인 개발자 투입(석사, 박사과정) 졸업~ 그렇게 해서 탄생한 XMLPipeDB

BOSC 2007 발표자료 2 - Introduction of the Japanese Open Bio* community

Bioinformatics 소프트웨어 개발을 위한 커뮤니티 운영 http://open-bio.jp
Workshops - 2004년이래 7회, GIW와 같은 학회를 통해서~
튜토리얼 - 2005년 KAST에서
사용자 그룹 - 소프트웨어 개발, 문서화, EMBOSS, BioPerl, Cytoscape 사용자 그룹
개발 소프트웨어들 - KNOB(KNOPPIX 기반의 bioinformatics 소프트웨어  라이브 시디), G-language(BioPerl기반의 Genome 분석 환경), BioRuby/ChemRuby, eXpanda(Perl 기반 네트워크 분석및 가시화 라이브러리), E-cell 3D, MedCD, BioFlash 등등