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질병 네트워크 - 알츠하이머와 천식

hongiiv 2008. 6. 20. 10:47
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알츠하이머천식이 관련이 있을까? 에이즈알츠하이머와의 관계는? 이러한 물음에 대한 접근을 보여주는 아주 재미있는 논문이다. 고려대학교의 고광일(물리학)교수의 논문이다. 처음에는 질병들간의 네트워크를 그리더니 이제는 약물과의 관계까지 ^^

The human disease network
Drug-target network
Mapping the Human 'Diseasome'

가장 기초적인 작업은 질병에 대한 정보를 제공하는 OMIM 데이터베이스에서 각 질병과 그 질병에 관여하는 유전자를 추출하고, 타 질병의 유전자와 일치하는 질병들간에 네트워크를 작성하는 것이다. 참 간단한 아이디어인데,,, 누구도 시도하지 않았다는것,,, ^^

박모박사님이 논문세미나 시간에 발표한 논문이었는데, 하나 그려 놓으면 재미있을것 같아서 데이터 파싱해서 일차적으로 Pajek을 이용해서 네트워크를 작성했다. 이제 질병의 카테고리별로 색상을 다르게 하고, 두 질병간의 공통된 유전자가 많을 수로 연결선을 굵기를 다르게 하는 것 정도만 추가하면,,, ^^ 암들은 서로 긴밀하게 엮여있군,,, 다음의 두 논문과 뉴욕 타임즈 기사를 기초로 작성하고 있고, 추후 작성 방법에 대해 포스팅 ^^;;

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질병 네트워크(일부 ^^)

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알츠하이머(Alzheimer disease)와  천식(Asthma)


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