생물학 데이터 포맷 GFF(Gene-Finding Format)

GFF, GBrowser File Format?? ^^, General Feature Format, Gene-Finding Format이라고 알려져있다. 자세한 GFF 문서는 여기에 나와 있다. 생물학 데이터를 표현하고 서로 교환하기 위한 데이터 포맷으로 GBrowse 등에서 사용되고 있다. GBrowse는 <Generic Model Organism Database Project>의 한 부분으로 앞서 언급한 GFF의 지원 이외에도 다양한 특징을 가지고 있다. 그 중에서 두드러진 특징은 바로 데이터의 공유라고 할 수 있다.

GMOD에서는 GMOD Community Meeting과 GMOD Summer School등과 같은 지속적인 행사를 갖고 있는데, summer school의 경우 3일간에 걸쳐 실제 GMOD의 GBrowser 등을 vmware상에서 설치하고 설정도 해보고 또한 토론도 하는 식으로 진행된다.

아마도 생물학이나 바이오인포매틱스 관련 해서 학회등에서 genome browser 세션 한번쯤은 다 들어 봤을텐데, 단순히 듣는 것으로 끝나는 것이 아니라 summer school처럼 실제 설치해보고, 더 나아가서 자신의 데이터를 가지고 커스트마이즈된 genome browser를 하나 갖고 나가게 된다면 참 재미있을 듯 하다.

국내에서도 저녁부터 새벽을 지나 아침까지(시간이 없는 분들을 위해) 밤새서 함께 모여 해보는 것도(Dev Night처럼) 재미있을 듯 하다. 단순히 genome browser 사용자라도 어떻게 이러한 browser가 만들어지는지에 대한 이해를 가지고 사용한다면 분명 연구에 많은 도움이 될것이라고 생각되긴 하는데,,,

로컬에 설치된 GBrowse - 그냥 명령어 하나면 설치 끝??