유전자정보분석

한국인의 유전적 정보 데이터베이스 KSNP에 대해서,,,

hongiiv 2008. 12. 12. 10:31
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한국인 유전정보
요즘 한국인 유전자 지도 완성과 함께 한국인, 유전정보라는 단어와 함께 유전적 변이의 하나인 SNP(스닙)에 대한 관심도가 증가하고 있습니다. 간단히 사람과 사람간이 차이를 바로 이 SNP을 통해 어느정도 이야기 할 수 있고, 이미 미국을 비롯한 외국에서는 이 SNP을 이용해서 한 사람, 가족에 대한 유전정보를 제공하고 있습니다. 그 대표적인 예가 바로 23andMe가 되겠죠,,,

유전체실용화 사업
우리나라에서도 일찍이 이러한 SNP 연구가 활발히 진행되어 왔고, 그 중심에 국립보건연구원의 유전체센터가 주도적인 연구를 진행해 오고 있습니다. 국립보건연구원은 2001년 부터 보건의료유전체연구사업내의 유전체 실용화 사업을 통해 한국인에 빈발하는 질병의 유전체정보를 수집하고 체계적으로 연구/관리하여 인간유전체 정보를 이용한 건강 증진 및 관련 첨단 기술을 보급을 목적으로 사업을 진행해 왔습니다.

KSNP 데이터베이스의 탄생
이를 통해 한국인의 질환후보 염기서열을 분석하여 SNP을 포함한 변이를 발굴하고 있습니다. 그 결과중 하나가 바로 KSNP-한국인 SNP 데이터베이스입니다. 외국에서도 dbSNP, JSNP 등의 SNP 데이터베이스가 구축되어 있으며, 국내에서도 KSNP DB System이라는 이름으로 현재 운영중에 있습니다. 2003년도 처음 만들어진 KSNP 데이터베이스는 2006년도에 한번의 업데이트가 있었습니다.

KSNP_2
현재 KSNP 데이터베이스의 모습, 한국인 유전변이를 외국의 데이터와 함께 비교 검색할 수 있다.

그래서 어쩌라고...
그런데 약간의 문제가 존재합니다. 이런거 블로그에 썼다가 짤리는거 아닌지 모르겠군요,,, 그동안 대규모의 사업(만명에 대한 유전정보 획득 사업으로 KARE라 불림)에 치중한 나머지,,,업데이트의 문제, 가시화 부분에서의 액티브엑스 문제 등등이 있음에도 불구하고 방치한 상태였습니다.

이런 문제를 해결하고자?? 09년도 부터는 제가 KSNP 데이터베이스에 대한 부분을 관리하게 되었습니다. 물론 새로운 형태의 UI(액티브엑스없는,,,)뿐만 아니라 SNP 정보 외의 다양한 컨텐츠를 통해 좀 더 연구자 및 일반인들에게 다가 갈 수 있도록 할 예정입니다. 요즘 일반인들도 황우석 교수나 광우병, 23andMe 등을 통해 너무 전문가들이 되셔서 ^^;; 또한 좀 더 많은 정보 획득의 요구가 있으셔서,,,

비록 제가 데이터베이스의 구축 등을 그동안 해온것이 아니라, 처음부터 삽질을 해야하는 상황입니다. 시작은 미약할지 몰라도 꾸준히 발전하는 모습을 보여드리려고 노력하겠습니다. 관심 많이 가져주시고 아낌없는 응원 부탁드립니다. 그리고 윗분들께 말씀드려서 KSNP 데이터베이스내에 블로그나 기타 다른 방법을 통해서 꾸준히 업데이트되는 내용이나 해당분야의 이슈에 대해서 언급하는게 어떨지 타진해 볼려고 합니다.(ensembl도 블로그가 있는데 말이죠,,,) 지켜봐주세요 ^^;;
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