단맛만좋아요

13 난쟁이 Berkeley에서 발표한 The Landscape of Parallel Computing Research: A View from Berkeley를 보면 난쟁이(Dwarf)라는 개념을 이용해서 병렬 컴퓨팅 환경에서 어플리케이션들을 집합을 가지고 통신 및 전산 공통 패턴에 대해서 정리하고 있다. 핵심적인 것은 17p~19p에 걸쳐서 총 13개의 Dwarfs와 각각의 Dwarfs들이 Embedded Computing, General Purpose Computing, Machine Learning, Graphics/Games/Databases에서 어떠한 형태로 발현? 되는지를 요약하고 있다. 또한 2008년도 자신의 연구에 대한 문서를 보면 각 Dwarfs(Motif라는 표현)와 컴퓨팅분야, 자신..

Blast Web Service를 제공하는 DDBJ, EBI와 내가 만든 Blast의 총 3개에 대하여 blastp, swissprot 데이터베이스, 서열(>gi|2501594|sp|Q57997|Y577_METJA PROTEIN MJ0577)에 대해서 Blast를 수행한 결과입니다. 결과는 당연히 똑같아야 하겠지만, Blast의 버전이 제가 2.2.14 버전으로 좀 낮고 swissprot데이터베이스는 DDBJ가 좀 틀리네요 ^^ 각각의 Blast 결과를 보시려면 more를 클릭하세요^^;; ========================================== ===========DDBJ BLAST with SWISS Prot=========== =============================..

blast를 사용하기 위해 ncbi에서 제공하는 toolkit을 설치하다가 깜딱 놀랐다. 설치 과정중에 수행되는 스크립트가 gcc를 사용하지 않고 xlc_r을 사용하는게 아닌가?? 이 놈의 머신이 IBM PowerPC라서 머신을 체크하다가 그냥 AIX라고 생각하고 xlc_r을 ㅠㅠ;; 버그 리포트라도 해야 하나? 다시 한번 드는 생각이지만, 그냥 x86머신을 사용하는 좋단 말이지... ppc와 ppc64의 차이로 인해 이런일이 일어나다니...