단맛만좋아요

엄홍길 대장님과 사진 촬영 후 바로 산으로 올라갑니다. 열심히 북한산에 오르고 있습니다. 흰장갑 끼고 나오는 개그맨 같은게 영~ ^^ 제 생각엔 여기가 정상인거 같아서 남들은 올라가지만, 전 내려왔습니다.

네이트온은 아직 맥에서 화상채팅을 지원하지 않고 있는 상황에서 물론 iChat도 있지만,,, 구글 챗에서 이젠 화상 대화도 지원하는군요. 간간히 구글챗을 유용하게 사용하고 있었는데, 이제 비디오까지 되니 :) 네이트온 분발해야겠네요 ^^ 맥, 파이어폭스에서 화상 대화중

가끔 제 블로그에 언급되는 것이 Ruby인데, 사실 루비를 아직까지 실무에서 써보거나 실제 루비를 이용한 프로그램을 작성해 본 적은 없다. 뭐 레일스 3분짜리 예제 하나 돌려본것이 전부 : ) 우연히 RailsConf Europe 08의 스케줄에서 Genomes on Rails란 제목을 보고는 허걱~ 생거센터의 스퀀싱 인포매틱스 팀을 맞고 계신 Matt Wood씨의 발표였다. 덧붙여 Green is Good이라는 블로그도 운영중이다. 여기 RailsConf의 발표 자료를 첨부~ 나도 얼른 이런 자료 하나 만들어야겠다는 생각이 문득... BioBlogRSS에도 등록! View SlideShare presentation or Upload your own. (tags: bioinformatics ruby) 슬..

굴소년이 드디어 손안에 들어왔다. 눈에 못이 박힌 소년, 오이스터 보이, 정크 걸 오늘 들어가 보니 벌써 품절이 ^^;; 역시 일찍 지르길 잘했다는 생각이 엇 뒤에 살짝 애플 블루투스 키보드가 보이는구나 : )

4대 지놈 브라우저(Genome Browser) UCSC, Ensembl, NCBI MapView, Gbrowse에 대한 소개 및 특히 Gbrowser에 대한 내용입니다. DAS를 통한 분산 주석 처리와 Genome의 특정 Region의 빠른 검색을 위한 R-Tree 알고리즘과 그 성능에 대한 간단한 자료입니다. 별 내용은 없음,,,(가끔 오타도 있는데 수정하기가,, ^^;;) View SlideShare presentation or Upload your own. (tags: ucsc ncbi)

수백개의 R 코드를 돌려야 할 일이 있다면, 한대의 컴퓨터에서는 100일이 걸릴일이라면 100대의 컴퓨터라면 100일 + 알파,, 요 알파는 각 컴퓨터에 로그인하고 R 코드를 옮기고, 명령어를 통해서 실행하고, 그결과를 취합하고,,, 여간 알파에 드는 시간이 많이 드는것이 아니다. 그래서 클러스터와 job 매니지먼트가 있다. 여기서는 리눅스 기반의 클러스터에 효율적으로 R 코드를 수백대의 컴퓨터에 실행하고 그 결과를 손쉽게 얻는 방법을 소개한다. 기본적으로 R의 경우에는 Interaction 프로그램으로 사용자와의 대화 형식으로 코드를 작성하게 된다. 명령->응답->명령->응답,,,의 형식 따라서 R 코드를 Bash에서 사용하기 위해서는 --quite, --no-save의 옵션을 통해서 처음 나오는 R에..