springer의 Machine Learning에 Structured Machine Learning: The Next Ten Years라는 글 중 Section 5(Ten Problems for the Next Ten Years)에 Machine Learning의 향후 10년안의 10개의 문제에 대해서 논의 하고 있더군요. Statistical predicate inventionGeneralizing across domainsLearning many levels of structureDeep combination of learning and inferenceLearning to map between representationsLearning in the largeStructured prediction w..
Genome Browser의 주요 기능은 1~10,000bp 또는 12,010,000~12,020,000 등등 chromosome 상에서 일정한 영역의 정보만을 DB에서 읽어와서 이를 다양한 형태로 출력해주는 것이다. 그럼 이러한 일정 영역의 데이터(feature)를 가져오는 SQL문을 만들어 보면,,, SELECT 온갖정보들 WHERE ref="Chr1" AND start = 12020000 그러나 위의 SQL문은 짧은 feature가 많이 존재하거나, chromosome의 중간 부분을 검색하는 경우에 있어서는 비효율적이다. 직접 HapMap 데이터를 기준으로 chromosome 9(총 140,273,252 bp)의 2,500,001에서 2,502,000 영역에 존재하는 feature를 검색하기 위해 ..
한 시간 동안 놀았습니다. ^^;;
GFF, GBrowser File Format?? ^^, General Feature Format, Gene-Finding Format이라고 알려져있다. 자세한 GFF 문서는 여기에 나와 있다. 생물학 데이터를 표현하고 서로 교환하기 위한 데이터 포맷으로 GBrowse 등에서 사용되고 있다. GBrowse는 의 한 부분으로 앞서 언급한 GFF의 지원 이외에도 다양한 특징을 가지고 있다. 그 중에서 두드러진 특징은 바로 데이터의 공유라고 할 수 있다. GMOD에서는 GMOD Community Meeting과 GMOD Summer School등과 같은 지속적인 행사를 갖고 있는데, summer school의 경우 3일간에 걸쳐 실제 GMOD의 GBrowser 등을 vmware상에서 설치하고 설정도 해보고 또..
보이지도 않는 벽 한 구석에서 열심히 파란빛을 발산하는 Airport,, USB 프린터와 스피커(아이튠)를 무선으로 연결해서 사용하는 기능도 있지만, 아쉽게도 USB 프린터와 그 흔한 스피커가 없기에 ^^;; 왠지 스태들러 제품을 갖고 있으면, 공부??가 잘 되는 느낌이 든다. 왜일까?? 원래 레고 시계에 같이 있던 축구선수였는데, 공은 어디로 도망가고 항상 책상위에서 나를 쳐다보신다. 그리고 맥북이 이상 소리없이 나를 은근히 돕고 있는 녀석들 되겠다. ^^