blogging 277

근황 토크

요즘 집단지성 프로그래밍 책을 읽으면서,, 저번에 좀 날림으로 만들었던 좌표를 이용한 주소찾기를 Machine Learning을 이용해서 좀 더 정확도와 신뢰도를 높일 수 있지 않을까? 라는 생각을 해본다. SVM(Support Vector Machine)을 이용하면 좀 될 것 같기도 한데,,, PLOS Computational Biology에 Machine Learning에 대한 글이 두개씩이나 된다. 하나는 전체적인 이야기이고, 다른 하나는 Bayesian Network에 관한 것,,, YOKOFAKUN 블로그에 따르면 illumina genotypes 데이터를 MySQL에다 집어넣어보고 그 속도에 실망하고는 , HDF5를 써보라는 권유를(smart한 fseek/fread/fwrite^^) 뒤로 하고..

blogging 2008.05.14

열차 무선 인터넷 사용하기 - KTX편

현재 무선 인터넷이 가능한 열차는 KTX 전열차와 새마을, 무궁화의 열차카페 연결 차량이라고 한다. 노브북이 없는 사용자들도 5,13호차에 설치된 컴퓨터를 통해 이용이 가능할 뿐만 아니라, 고속철도 역사에서 오천원의 렌탈 비용을 받고 노트북도 렌탈해준다고 한다. 마침 오늘 대전으로 내려오는 길에-모든 열차가 매진이란다. 역시 연휴이긴 연휴인가 보다 ^^- 거금 천원을 투자해서 한번 사용해 보고 있는 중이다. 열차에서는 현재 사용설명서를 배포하고 있어서 자세한 정보를 볼 수 있다. 열차에서의 AP의 위치는 3, 5, 8, 11, 14, 17호차에 설치되어 있기 때문에 그나마 원활한 인터넷 사용을 위해서는 가급적 위의 호차에서 사용하는 것이 좋을 듯하다. 지금 현재 17호차에 탑승하고 있는데,, 간단한 인터..

blogging 2008.05.10

사파리에서 한글 입력 문제

Safari에서 한글 입력이 되지 않는다는 긴급 제보를 받고 들어가보니 진짜루 한글이 입력되지 않는 일이 벌어지고 있었습니다. 이런 맥을 쓴다는 놈이 자기 블로그가 사파리에서 한글 입력이 되지 않는 것도 모르고 있다니,,, 문제점을 해결하고자, 스킨을 변경해서 한글을 입력해보니 잘되는것이었습니다. 그럼 문제는 CSS뿐,,,, CSS의 textarea 부분에 font-family가 두번 지정되어 있었습니다. 그외에는 뭐 봐도 모르겠구,,, 하나 살짝 지웠더니 한글이 입력이 잘되는 ^^;;; 물론 윈도우용 Safari가 아니라 맥용 Safari입니다. 이 자리를 빌어서 다시 한번 lordmiss님께 감사를,,,,^^;; 코멘트는 글 내용과 상관없어도 상관없습니다. ㅋㅋㅋ

blogging 2008.04.23

Programmable Web에 등록된 Reverse Geocoding API

일전에 지도상의 좌표에 해당하는 주소를 반환하는 API를 만들고 나서, Programmable Web에 등록했는데 몇주가 지나도 등록이 안되어 있길래 안되나 부다 했더니, 오늘 가보니 등록 되었습니다. ^^;; 등록된 이상 좀더 신경좀 써서 개선해나가야 할 책임감이 생겨버렸습니다. (^____^);; Geocoding Service for Korea 란 이름으로 등록되었군요,,,왜 이렇게 등록이 더딘거야~ 좀더 채워 나가야지,,ㅋㅋㅋ

blogging 2008.04.21

BioBlogRSS 방문자 통계 정보

BioBlogRSS의 통계 정보를 공개합니다. 공개하는 의미는 뭐 궁금해 하실까봐??? ^^;; 이런 정보를 통해 좀 더 여러분들의 사랑을 구하는 구애 활동이라고 할 수 있겠습니다. :) 간단하게 살펴보면 매일 200명 이상은 방문하고 있습니다. 뭐 실제 방문자는 여기의 몇 %를 차지하는지는 모르겠지만,,, 여기서 방문자 활동 정보가 매우 재미있는데요,, 조회율이 약 6%로 대부분 제목들만 보시고 실제 해당 블로그는 가보지 않는다는 그런 의미겠죠. 그렇다면 좀 더 블로그의 글을 적극적으로 소개하는 방법으로 비누인형님이 잠깐 언급하셨던(댓글에서,,) 올블로그의 티페이퍼와 같이 BioBlogRSS의 글을 주 또는 월 단위로 뽑아서 간단히 소개하는 형식을 통해 좀 더 좋은 글들을 알리 수 있지 않을까라는 생각..

blogging 2008.04.18

Drug Discovery and Developement 후기?

어제 저녁 11시부터 Drug Discovery and Developement 가 시작되었다. 첫째날인 어제는 Drug Discovery라는 주제라기 보다는 요즘 많이 회자되고 있는 Grid, e-Science, 협업, High Performance Computing의 주제로 일전에 분자설계연구소에서 개최한 Virtual Laboratory based on GRID Tech와 엇비슷?한 주제였다. 내가 듣고 싶었던 세션은 mpiBLAST를 만든 Wu Feng 교수의 Parallel Sequence Search with mpiBLAST였는데,, 그만 그전에 잠이 들어버렸다. 이런, 이거 들을려고 그렇게 안자고 있었건만,, ㅜㅜ 그건 그렇고 요즘 왜 이렇게 Grid기반(High Performance Comp..

blogging 2008.04.17

아이폰에서 fring을 이용한 전화통화

드디어 아이폰용 fring이 나왔습니다. 이전까지 SIP-VoIP를 이용한 인터넷 전화는 마이크가 작동하지 않아서 상대방에게 음성을 전달하지 못했는데,, fring에서는 완벽하게 상대방과 통화가 가능해졌습니다. fring의 설치는 여기를 참고 하시면 됩니다. ^^; 조금있다가 회의가 있어서,, 짧게 점심시간에 찍은 동영상 올립니다. MSN을 이용한 문자 및 음성 가능합니다.SIP를 지원하는 imtel의 서비스를 이용한 전화 가능합니다. Skype는 아직 테스트 하지 못했습니다. 테스트 완료했습니다. Skype Out을 통해 구매한 크레딧으로 전화 통화 해봤습니다. imtel과 Skype 통화품질은 글쎄 잘 모르겠네요. ^^;; Skype의 경우 +82와 같이 +와 국가번호를 붙여야 합니다. 국내의 경우 ..

blogging 2008.04.16

BioStar 1.0 버전을 공개합니다.

BioStar 1.0 버전을 공개합니다. 이 프로그램은 바이오인포매틱스와 관련된 거의 모든 일을 할 수 있는 프로그램입니다. 특징으로는 작은 크기와 커맨드라인 기반의 사용이 간편하기 때문에 초보자도 쉽게 사용이 가능하다는 것입니다. 프로그램다운로드 개인적으로 오랫동안 이 프로그램을 개발해 왔으며, 현재 Taverna를 비롯한 다양한 워크플로우와 연계되어 사용될 수 있도록 작업 중에 있습니다. 많은 분들에게 유용한 프로그램이 되었으면 좋겠습니다. 여기 lordmiss님이 저와 유사한 프로그램을 만드셨습니다. 화학정보학 프로그램으로 기능상으로는 제가 만든것 보다 훨씬 나아 보입니다. 참고 하시는것도 좋을것입니다. ^^

blogging 2008.04.15

정보를 효율적으로 인식하기 좋게 표현하기

우선 정보나 데이터를 구분해서 사용하기도 하지만(정보는 "뜻을 가지는 데이터"라고 하여 구정보와 데이터를 구분하기도 한다) 여기서는 그냥 구분짓지 않는다. ^^;; 데이터(정보)의 시각화(Visualization)는 정보나 데이터를 효율적으로, 직관적으로 이해(intuitive understanding)할 수 있게 표현하는 방법이다. 이러한 시각화는 우리가 인지하지 못하지만 많은 분야에서 사용되고 있다. Bio* 관련 논문들을 보면 visualization이라는 단어가 들어가는 논문들을 심심치 않게 볼 수 있다. 리눅스 커널 시각화 다음의 그림은 리눅스의 커널을 시각화한 것으로 각각의 색상은 다음을 나타낸다. 이그림 한장으로 복잡하고 거대한 리눅스의 커널을 한눈에 쉽게 볼 수 있다. 소스 파일과 헤더 파..

blogging 2008.04.14