blogging 277

GenomeCloud 내부를 파헤치자

많은 분들이 GenomeCloud가 내부적으로 어떻게 클라우드 자원을 관리하고 유전체 데이터를 분석하는지에 대해서 궁금해 하셔서 간단하게 기술적인 설명을 해볼까한다. 일반 생물학 연구자들도 한번쯤 읽어두면 자신의 데이터가 어떻게 분석되는지 연구에 활용하려면 GenomeCloud를 어떤식으로 해야 할지에 대한 폭 넓은 안목을 가지게 될 수 있으니 강추!!! (-.-;;) 1. ucloud biz (클라우드 자원) CPU/메모리/디스크/OS/네트워크 등의 개별 자원을 제공하는 서비스로 GenomeCloud는 분석할 대상에 따라 개별 자원들을 조립하여 사용합니다. 분석에 대한 요청이 들어오면 개별자원을 조립하고 분석을 수행한 후 다시 개별 자원을 반납하게 됩니다. ucloud는 하나의 가상서버(Virtual ..

blogging 2013.04.24

유입 키워드로 보는 내 블로그

블로그의 유입 키워드를 보다가 재미난것들이 있어서 소개해 보려고 한다. 걍 빵 터지는 것은 없어도 ㅋㅋㅋ 서정선 이종은 한국인 백인유전자 개체 'ensembl'이 없습니다 수전증 아빠 원인 적금해지비율 난 단맛만좋아 남자친구 귀지 서정선 교수와 이종은 사장을 나란히 검색한 사람은 과연 뭘 알고 싶었을까? 두사람이 사귀나 뭐 그런거?? -.-;; 한국인 백인유전자 서양인과 결혼하면 됩니다. 앙상블을 설치하세요 수전증은 아빠가 원인이 아니라 술을 끊으세요. 적금은 오래 가지고 계세요. 단 맥북 사시려거등 해지하세요 나도 단맛이 좋습니다. 파주세요....

blogging 2013.04.09

Mac OSX 에서 Eclipse 폰트 안티알리아싱

Eclipse에서 요즘 코딩할 일이 있어서 좀 사용하고 있는데, 이게 Mac에서는 폰트 알리아싱 때문에 가독성이 확 떨어져 버린다. 그렇다고 제어판에서 일정 크기 이하의 폰트에서 알리아싱을 해제하는 옵션을 사용하면 Mac의 모든 어플리케이션들의 폰트에 영향을 주기 때문에 난감하다. 다음과 같이 콘솔에서 명령을 사용하면 이클립스에서 좀더 깔끔하게 가독성 있게 프로그래밍이 가능하다는... 별쓰잘데기 없는것일 수 있지만, 요즘 들어 한짓거리 중에서 제일 뿌듯한 짓거리라는... defaults write org.eclipse.eclipse AppleAntiAliasingThreshold 20

blogging 2013.03.16

한달간 블로그 페이지 방문자의 성향

내 블로그를 방문 대부분은 South Korea로 부터 트랙픽이며, 50%는 홈에 먼저 첫발을 내딛지만, 대부분은 홈화면만 보고 떠나 버린다. 하지만 떠나지 않고 꾸준히 다른 페이지를 보고보고보고 또 봐서 12페이지까지 보고 가신분도 있다는 것... 감사합니다. 뉘신지는 모르겠지만... 그렇다면 홈외에 들어오시는 분은 "R 그래프 그리기" , "PCA using R" , "CTO 당신만 보세요 - 바이오인포매틱스와 Hadoop의 만남은 필연적" 페이지를 방문했다. 즉 검색을 하던 어디 링크를 타고 들어왔건간에 홈을 제외한 이 3개의 페이지가 지난 한달간 줼로 인기 있었다는 이야기가 되겠다. 고로 내 블로그는 이것저것 잡단한 것을 쓰지만, 정작 블로그를 찾는 분들은 R 댐씨 온다는 이야기?? -.-;;

blogging 2012.05.10 (2)

하버드와 Broad가 있는 보스턴 캠브리지

삼지창 카페 어제 밤 보스턴에 도착하고 나서는 철저한 숙면을 취한후 아침에 느긋하게 브런치로 호텔 근처의 Newbury가에 있는 Trident Bookseller & Cafe로 향했다. 책과 함께 음식을 파는 곳인데, Newbury는 하인즈컨벤션센터역에서 부터 시내까지 쭉 뻗은 길로서 나름 이동네에서 쇼핑으로 유명한 길거리라고 한다. 에그베네딕트를 주문하고는 처묵처묵,,, 감자는 별로구 커피는 좋았구 계산하기 계산서 달라고 한 후 신용카드를 끼워서 놓으면 가져가서 카드 긁어서 손님용/가게빵용/원래계산서 요렇게 3개를 다시 가져온다. 다시 가게빵용에는 택스 포함한 가격이 나오고 밑에 팁/합계가 공란으로 나온다. 팁란에 팁 적고 합계 적어주고 걍 나온다. 아니 걍 나오라고 했다. 근데 결제는 원래 요금만 나..

blogging 2012.04.25

Genome 관련 최신 소식 보기

GenomeWeb 기사는 몇몇 내용을 제외하고는 유료로 기사 읽기가 가능합니다. 가끔 링크를 따라가면 간혹 본문 내용을 읽을 수 있기도 하고,,, 암튼 제목만으로도 충분히 많은 최신의 소식들을 접할 수 있는 있는 곳인데요. 오늘은 이 기사를 꼼수를 이용해서 볼 수 있는 방법을 알려드리려고 합니다. 물론 어떤 불법적인 요소는 없습니다. 1) 읽고 싶은 기사가 있는데 자물쇠 모양의 아이콘이 있다면 우선 기사의 제목을 복사합니다. 2) 구글검색에 해당 기사의 제목으로 검색합니다. 3) 제일 위에 뜨는 검색결과는 분명 genomeweb일겁니다. 4) 저장된 페이지를 누르지 않습니다. - 얼마전까지만 하더라도 캐시에 실제 기사내용이 들어있었는데 언제부터인지 안되더라구요 5) 저장된 페이지가 아닌 이페이지 번역하기..

blogging 2012.02.14 (2)

GIW 2011 / BIOINFO 2011 참가 후기

지난 월요일부터 수요일까지 부산 그랜드 호텔에서 GIW 2011/BIOINFO 211 컨퍼런스가 있었습니다. KT도 약간의 후원하게 되었고, 그에 따라 참가하게 되었습니다. 조만간 KT도 멋진 발표를 할날을 기대하며....ㅋㅋㅋ 간단하게 리뷰에 들어가겠습니다. 행사장 전경 KT도 후원했습니다.!!! Information-based design of drug repositioning and combiniation 김성훈 교수 (서울대학교 약대) 서울대 김성훈 교수님의 발표로 기존 약물의 새로운 기능을 밝히기 위한 자신의 PharmDB에 대한 설명이 있었습니다. My Samples, My Study, My Sequencing 김경아 (BMS) 일루미나의 국내 총판을 담당하는 BMS의 발표로 일루미나의 HiS..

blogging 2011.12.08 (2)

블로그 이제 정리합니다.

"보건복지부 질병관리본부 국립보건연구원 유전체센터"에서 7년이 넘는 시간을 보내고 5월 2일부터는 KT로 출근합니다. 학교를 졸업하고 처음으로 발을 디딘곳이 유전체센터였고, 그 곳에서 너무 많은 분들의 도움으로 많은 것들을 배우고 또 많은 것들을 경험하게 되었습니다. 생물학의 전반적인 부분이나 유전체, 통계에 대한 풍부한 지식을 가진 많은 분들과 함께 일을 할 수 있어서 저에게는 매우 즐거웠던 시간이었었고, 그러한 분들이 없었더라도 지금의 저는 분명 없었을 것입니다. 마지막으로 한분 한분 만나뵈면서 인사를 드린다고는 했지만, 미처 인사를 드리지 못한 분들께 다시 한번 이 자리를 빌어서 감사하다는 말씀 드리고 싶네요. 많은 분들이 연구하던 놈이 왠 전화국이냐?라고 말씀하시는데… 이 부분에 대해서는 따로 기..

blogging 2011.05.01 (14)