많은 분들이 PubMed의 내용을 RSS로 읽어 들어 자신이 관심있는 논문을 읽어들이는 방법을 사용하고 계신데요. 저도 여기에 제 방법을 소개해보려고 합니다. 이제 웹브라우저 하나 띄어 놓으시고 천천히 따라 하시면 됩니다. 1. Yahoo Pipes 서비스에 가신 후 상단의 검색 창에 "pubmed"로 검색하시면 "PubMed search(v1.0) / RSS"라는 파이프가 있습니다. 2. Search PubMed 입력창에 자신이 관심있는 키워드를 입력합니다. 저는 SNP과 RS(dbSNP의 RS번호가 들어간 논문을 찾기 위해)를 키워드로 등록했습니다. 이 서비스는 NCBI의 Entrez의 Esearch를 사용해서 PubMed의 제목과 요약 부분을 등록된 키워드로 검색해서 보여주도록 하는 파이프입니다. ..
금요일 저녁 5시 신촌 스타벅스에서 OBK 모임이 시작되었습니다. 마이클, 김동준(국립보건연구원), 김영진(국립보건연구원), 저(국립보건연구원) 이렇게 4명과 바로 모임 장소 앞에서 terra19(오태윤)님을 만나서 같이 모임 장소인 스타벅스로 들어갔습니다. 마이클, 오태윤, 김동준, 가려진 김영진 사람들을 기다리면서 마이클과 SNPedia와 Promethease에 대해서 이야기를 했습니다. SNPedia에 대해서 간략히 요약해 보면 다음과 같습니다. SNPedia는 genetics를 위한 Wikipedia이다. SNPs, CNVs, microRNA에 대한 정보를 보여준다. Yahoo Pipes를 통해서 논문중에 SNP 정보(RS번호)가 있는 글(NCBI의 Entrez 서비스 사용)들을 읽어 들이게 됩니..
인플루엔자(독감)은 바이러스에 의한 급성 호흡기 질환으로 2000년 제3군 법정전염병으로 지정되어 전국 680여개 보건의료기관을 통해 표본감시로 운영되고 있습니다. 질병관리본부에서는 매주 인플루엔자 표본감시 소식지를 발행하고 있는데요, 지난 1년간 인플루엔자 의사환자(38도 이상의 갑작스런 발열과 더불어 기침또는 인후통을 보이는 경우, Influenza-like illness,ILI)분율 (1,000명당 2.6명을 초과하면 독감이 유행하고 있다고 봄)을 각 지역별로 통계를 내 보았습니다. 울산의 경우는 전국 평균의 두배를 보이고 충북은 가장 낮은 수치를 보이고 있습니다. 이 수치만 본다면, 충북에 살고 있다면 독감에 걸릴 확률이 가장 낮게 되겠지요 ^^;; 자! 독감에 걸릴 확률을 확--- 줄이고 싶으시..
요즘 벚꽃이 만발한게 날씨가 너무 좋습니다. 어제는 에어컨까지 틀어 놓을 만큼 더웠는데, 오늘도 역시나 날씨가 너무 좋은게 일하기 딱 싫은 그런날입니다. 그래도 다행인것이 오늘만 지나면 주말이라는거 ^^;; 예전에 만들었던 구글맵 기반의 genome browser를 다시 한번 들여다 보다가 정리가 안되는 바람에 우선 프리젠테이션 자료로 만들어 봤습니다. 이렇게 해 놓으면 까먹진 않겠죠 ^^;; 몇개월동안 손을 놓고 있었는데 슬슬 다시 시작해 볼까 합니다. ^^ View more presentations from Hong Changbum.
"삼성SDS(대표 김인)와 가천의과학대학교(총장 송석구), 한국 생명공학연구원(원장 박영훈)은 6일 삼성SDS 본사에서 삼성SDS 정보기술연구소장 박승안 전무와 가천의대 이길여암·당뇨연구원의 김성진 원장, 박종화 한국생명공학연구원 국가생물자원정보관리센터장이 참석한 가운데 바이오인포메틱스 기술 개발을 위해 양해각서를 교환했다." 오늘자 기사군요, 몇 주전 이 삼각구도를 들었었는데, 실제 기사가 나왔군요. 이 이야기를 듣고 생각난 것 몇 가지? 1) 그렇게 떠들어 댔던 맞춤의학, 예방의학이 이제 삼성이 손을 댈 만큼 성숙한 건가? 제가 알기로는 삼성계열은 돈 되지 않으면 잘 안움직이는 걸로 아는데,,, 여기에 대해서 아시는 분은 댓글 좀^^;; 2) 마지막에 구글을 언급하는건 23andMe일텐데,,, 최종 ..