단맛만좋아요

일전에 저희 센터에 NGS에 관련해서 Applied Biosystems에서 발표를 했었습니다. 앞부분을 조금 녹화해봤습니다. 제 맥북을 보고 자기도 가지고 있다고 그러는군요 ^^;; 1000 Genome 프로젝트에서 SOLiD를 가지고 시퀀싱한 후 분석한 내용에 대해서 간략하게 설명한 내용입니다. 목소리 출연: 나, 김군 주연: 맥스, 팀장님

요즘 genome browser(뭐 이미 공개된 브라우저에 데이터만 넣은거지만,,)를 만들고 사람들에게 한번 써보라고 했다. 내 생각: 검색어에는 자신이 원하는 gene이름, snp번호, 염색체상의 일정 영역등 자세한? 내용을 넣어 검색해 주기를 원했는데,,, 사용자 생각: 검색어에 그냥 당뇨, 인슐린, 유방암 이렇게 넣어버렸다. 차이: 브라우저의 용도에 맞는 검색어를 넣어주기를 바랬지만, 실상은 그렇지 않았다. 너무 포괄적인 검색어를 넣어 버리는 바람에 검색 속도가 늦어 버리는 결과가 생겨 버린것이다. 사용자에게 이건 이런 용도니까 이런 검색어를 넣고, 접두사는(사이트 검색시 site: 처럼) 뭐를 넣으세요. 설명한다면 그건 내가 지는 거다. 아니 내가 잘못 만든거다. 그럼 해결책은 광범위한 검색어를 ..

오늘 애플 홈페이지에 들어가 보니 아이팟 셔플의 새모델이 나와있네요. 더욱 크기도 작아지고, 그동안 셔플의 문제였던 외부 디스플레이가 없어서 불편했던 점을 "말하기"로 날려버렸네요. 근데 스몰토크를 보니 프로그래밍 랭귀지가 생각나는건,,,, 곡명과 아티스트, 재생목록의 이름, 배터리 상태까지도 알려 준다고 하네요. 셔플은 셔플 나름대로 아이팟과는 다른 형태로 잘 진화되는것 같습니다. 갑자기 셔플이 급 갖고 싶어지네요 ^^;;

UCSC Genome Browser는 HGP를 가져갔고, GBrowser는 HapMap을 가져갔고, Ensemble은 1000 Genome을 가져갔다. 그동안 Ensembl이 제일 불쌍했었는데, 들리는 소문에 의하면 Ensemble은 전세계를 투어하면서 자신들의 Browser를 활용하는 방법에 대해서 강연도 해준다고 한다. 이로써 셋이 나란히 한 프로젝트씩 나눠가졌다. 개인적으로는 GBrowser가 제일 좋은듯,,,^^;; HapMap with GBrowser 1000 Genomes with Ensembl

요즘 요렇게 해놓고 일하고 있습니다. 말이 필요없겠죠 ^^;;

아래와 같이 HTML 폼에 자신이 원하는 문구를 입력한 후 "Get PDF" 버튼을 클릭합니다. 그러면 요렇게 생성된 PDF 파일을 저장할것인지, 열것인지 물어보죠 ^^;; 열기를 선택하면 요렇게 뷰어가 실행되면서 생성된 PDF를 볼 수 있습니다. 상단에는 아까 입력한 문구가 들어가도록 PDF문서를 만들었습니다.