단맛만좋아요

그동안 iPhone의 펌웨어 업그레이드를 하지 않고 있었다. 지금 사용하고 있는데 기능상으로 전혀 문제가 없었기 때문이기도 하지만, 귀차니즘으로 인해 아이튠즈에서 업그레이드 할거냐는 물음에 항상 "아니오"로 일관하고 있었다. 그러던 중 맥에서 논문정리로 사용하고 있는 Papers를 버전 1.9로 업그레이드를 하면서 iPhone과 동기화 될 뿐만 아니라, 손쉽게 iPhone에서도 PDF 파일을 읽을 수 있어서, 구매를 하려고 했더니 현재 iPhone에서 지원하지 않는다는 에러를 내뿜었다. 바로 펌웨어 업그레이드를 수행하고 탈옥을 시도 했다. PwangeTool은 펌웨어 2.2.1_5H11을 제대로 지원하지 않는다. 업그레이드 된 펌웨어는 2.2.1_5H11 버전으로 처음에 PwnageTool로 Custom..

엊그제였나? 새벽에 티비에서 비열한거리를 방송하는데, 초코파이 10초안에 먹기 내기를 하는 장면이 나온다. 발렌타인데이를 맞아 초코파이가 몇개 생겨서 김군과 30만원 내기를 했다. 성공하는 사람한테 주기로,,, 결과는 초코파이를 씹지 않고 꿀떡 삼킨다면 성공할지 몰라도 씹는 순간 머리속에 드는 생각은 "10초가지고는 어림도 없는데,, 침은 다 어디로 간거야??" 한번 해보시고 성공하시는분은 연락주세요, 초코파이 한상자 드릴께요 ^^ 덧) 공정한 게임을 위해 둘다 먹는 모습을 핸드폰 동영상으로 남겨놨는데, 차마 공개하기가~~

예상외로 많은 분들이 답변을 해주셨습니다. 감사드립니다. 설문의 내용이 뒤죽박죽이라는 많은 질타를 받았습니다. 다시 한번 이부분에 대해서 사과 말씀 드리겠습니다. ^^;; 본 설문의 목적은 사람들의 유전자 검사에 대해서 얼마만큼 관심을 갖고 있는지에 대해서 알아보고 그렇다면 이러한 유전자 검사시 사람들이 바라는 점은 무엇인지에 대해 자세히는 아니지만 한번 알아보고 싶어서였습니다. 기본적으로 설문을 함에 있어서 목적을 명시하고 기타 설문의 내용에 대해 충분한 숙지가 있어야 함은 기본일텐데 이런것 다 무시하고 열심히 설문에 응해 주셔서 다시 한번 꾸벅~ 그럼 간단하게 지금까지 총 80여분이 설문에 응해 주셨습니다. 워낙 설문 자체가 엉망이라 결과는 제가 좀 묶어 놨습니다. 중복스러운 내용도 있고 해서~~ 첫..

본 설문은 지난밤에 횡설수설 작성된 것이며, 일관성 없고 질문 또한 중복적일 수 있습니다. 그냥 마우스 가는 대로 작성해주시면 참~고맙겠습니다. :) 자! 그럼 시작합니다. 로드 중입니다...

이제 사무실에서 업무를 보기 위해서는 말로만 듣던 Thin Client를 통해서 Blade 서버에 접속해서 사용해야 한다. ㅠㅠ,, 이미 HP t5630에 Windows® XP Embedded SP2가 설치되어 있었다. 그럼 요놈을 말그대로 thin client로 사용할 것인가?? 우선 USB에 우분투 부팅 이미지를 만들어서 우분투 부팅은 성공했구,,, 이제 네트웍만 어떻게 우회하면 ^^;; 잡혀갈려나,,, HP t5630

천신만고 끝에 spit sample이 미국의 지인에게 도착했고, 이어서 다시 23andMe에 잘 전달되었다는 메일을 받았습니다. 분석은 8-10주 두달 넘게 걸린다는군요, 그럼 4월달에는 결과를 받아 볼 수 있을것 같습니다. 그전에 23andMe에서는 간단한 설문을 하고 있는데,, 대충 이런것들입니다. "당신은 유당불내증(lactose intolerant) 정도는?" 즉 우유를 먹으면 배가 꾸르륵 거리냐는 것같이 실제 유전자와 관련된 trait에 대한것들을 물어보고 있습니다. 유당불내증 관련 SNP과 일치하는지 확인해 볼 수도 있고 23andMe 이용자들과 비교해 볼 수도 있습니다. 대부분의 사용자들이 우유 먹어도 괜찮다고 하는군요 ^^;; 저도 설문을 시작했는데,, 향후 이런 설문 결과와 실제 geno..

데이터가 돌고 있을땐 마땅히 다른일을 하고 싶지가 않다. 멍하니 디버깅 메세지를 쳐다 보거나, 음악을 듣는게 고작이었는데,, 요즘은 미국 돌아다니는 재미에 푹 빠졌다. 오늘은 뉴욕 브로드웨이를 구글맵으로 휘젓도 돌아다니다 타임 스퀘어에서 LG 발견,,, 혹시나 하고 다음 지도를 통해서 한국의 타임스퀘어?? 종로 교보타워를 가보니 왠걸 여기도 LG,,, 특별히 LG를 좋아한다거나, 지인이 있는건 아니지만,, 암튼 반갑다~~!! 그나저나 LG전자 제품이 나에겐,,,, 없네 ^^;;

더욱더 늘어난 저 선들은 어쩌냐고,,, 오늘은 두 가지 기본에 대해서 짚고 넘어가려고 한다. 첫번째는 매뉴얼을 읽지 않는다는것, 내가 만든 매뉴얼은 다른 사람이 읽지도 않고 질문한다고 뭐라고 하는데,,, 나또한 정작 외부 시스템을 사용할때는 매뉴얼을 읽지 않는다... KISTI 슈퍼컴 사용 매뉴얼을 읽지 않고 그냥 job을 던졌다가 낭패 ^^;; 10분정도 시간을 내어 읽어봤다. 디버그 노드에서 mpi 작업을 실행해 볼 수 있다니 비록 30분이긴 하지만,,, 매뉴얼 잊지 말자!!! 두번째는 공개된 데이터에 대한 문제이다. 아무 생각없이 last 폴더를 받았는데,,, 이런 설날 전에 넣은 데이터는 멀쩡히 잘 visualization이 되는데 설 이후 받은 데이터는 보이질 않는다, 설날 후에 last 폴더는..

일전에 포스팅에서도 잠깐 언급했었는데,, 현재 KSNP 데이터베이스를 gbrowse 기반으로 작성하고 있습니다. 그런데 여기서 인종별로 SNP의 빈도를 파이챠트 형식으로 보여주는 부분이 있습니다. 한국인의 경우에는 만명에 대한 Genotyping 결과를 토대로 작성되었구요. HapMap에서는 빨강,파랑으로 보여주는데 영~ 맘에 들지 않는군요, 그래서 한번 제 맘대로 바꿔 봤는데 이것도 영~~~ 좋은 색상 조합있으며 댓글로 남겨주시면 그 중 제일 맘에 드는 놈으로 바꿔 보려고 합니다. 여러분이 제안한 색상 조합이 한국인을 대표한는 Genome 브라우저에 사용될 수 있으니까요 : ) HapMap의 원래 색상 바꿔본 색상

KISTI 슈퍼컴퓨팅센터의 tachyon의 경우 사용자당 10개의 job만 제출할 수 있다. 따라서 실행할 작업이 시리얼한 작업일 경우 한번에 10개 이상의 노드를 사용하기 위해서는 아래와 같이 MPI 코드로 래퍼를 만들어서 실행하면 원하는 갯수 만큼의 시리얼 작업을 한번에 수행할 수 있다. script_0.sh ~ script_N.sh의 스크립트를 미리 만들어 놓은 후 실행 스크립트에서 #$ -pe mpi_fu N으로 지정하면 N개의 스크립트를 하나의 qsub로 해결~!! =====mpi_wrapper.c===== #include "mpi.h" #include #include int main( int argc, char *argv[]) { int done = 0, n, myid, numprocs, i;..