Day1 - Genome Data 받기
Genotyping 데이터나 Sequencing 데이터의 가격이 점차 하락과 함께 23andMe나 deCODEme와 같은 DTC(소비자직접거래) 방식의 Personal genome 서비스를 통해 자신의 질병에 대한 유전적인 소인이나 자신의 조상에 대한 정보를 얻을 수 있게 되었다. 23andMe 서비스를 받았다면, 자신의 Genotype 데이터를 따로 받을 수 있다. 23andMe에 로그인한 후 Download raw data를 선택하면 자신의 genotype raw 데이터를 다운로드가 가능하다. SNPTips를 사용하면 firefox web browser를 pop-up 창에서 SNP 정보를 확인할 수 있게 된다. 23andMe에서도 이와 비슷하게 SNP 정보를 확인 할 수 있다. 23andMe의 경우 ..
어떤 민족이 우월하거나 그렇지 않다거나, 동남아인, 혼혈을 무시한다거나, 이상한 눈으로 바라본다던가, 백인을 보면 굽신거린다거나 머 이런거 저는 없습니다. 아니 그러한 편견?을 가지지 않으려고 노력합니다. 암튼 각설하고, 요번에 한국인이 조상이 동남아에서 유래 되었다는 사이언스지의 논문 "Mapping Human Genetic Diversity in Asia" 넵, 여기서 사용한 한국인 데이터는 바로 제가 일하는 질병관리본부 국립보건연구원 유전체센터 형질연구과(헉~ 너무 길다)에서 생산된 정보입니다.그런데 이 논문에서 이야기 하는 아시아 민족이 사용하는 언어,지리적인 위치, 인종이 잘 매칭된다는 점이 너무 부각이 안되고, 그저 한국인의 조상이 동남아라는 것만 너무 크게 부각되었죠 ^^;; 개인적으로 이렇..
전세계적으로 소비자 직접 거래(Direct-to-consumer, DTC) 방식의 유전자 검사를 하는 회사는 23andMe, Navigenics, deCODE가 대표적이라고 할 수 있는데, 이들 서비스에 대한 내용이 2009년 하와이에서 개최된 ASHG Annual Meeting의 포스터 나와서 간단히 소개하려고 합니다. 다름 아닌, 크레이그 벤터 연구소에서 5명에 대해서 23andMe와 Navigenics의 서비스를 받아보고 그를 비교해봤다고 합니다. 결과는 향후 시퀀싱이 발전한다면 rare한 변이로 인해 발생되는 질병도 곧 알 수 있을 것이라면서, 향후 full genome 시퀀싱에 대해 부푼 꿈을 이야기하고 있네요 ^^;; 근데 왜 이런걸 벤터가 포스터를 냈을까요? 아마도 향후 full genome..
========= 2009.03.26 ========= Hong Chang-Bum: 23andMe v2, male, Korean Download 23andMe raw data More information SNPedia: http://www.snpedia.com/index.php/Genomes 23andMe: http://www.23andMe.com ========= 2009.04.22 ========= 23andme New Data!! Revision History April 9, 2009. Analysis of our data has allowed us to improve the interpretation of 10 SNPs: rs4420638, rs34276300, rs3091244, rs34601..
몇일전에 23andMe의 블로그에 파킨슨병에 대한 내용이 올라왔습니다. 일전에 구글의 창업자인 세르게이 브린이 23andMe를 통해서 자신 파킨슨병에 대한 민감도가 높다는 검사 결과와 함께 가족력도 있다고하여 한때 구글의 주가가 살짝 내려가는 소동도 있었는데,, 그걸로 끝나는게 아니었습니다. 파킨슨병 연구소와, 마이클제이폭스재단, 그리고 구글의 세리게이브린의 돈?의 도움을 받아 만명(명수는 저희 연구소와 같군요 ^^)에 대해서 25달러라는 파격적인 가격(원래는 399달러죠)으로 검사를 하고 이를 파킨슨병 연구에 쓴다고 합니다. 기본적으로 많이들 하는 GWAS를 이용한 연구가 되겠지만, 샘플을 모으는 방법이나, 그 과정이 꽤 흥미로울것 같습니다. Research 2.0 어쩌구 ^^;; 이미 23andMe에..