단맛만좋아요

Bioworks의 qna에 올라왔던 로그인이 안된다던 문제가 저에게도 생겼습니다. 단순히 kisti측에서 작업을 하고 있어서 안되는건지 뭔지?? 잘 모르겠지만, 로그인이 안되는 문제가 저에게도 ㅠㅠ 처음에는 로그인에 이상이 없었는데, 워크플로우 하나 돌리니깐 Bioworks가 그냥 종료되더라구요. 그 다음부터 이런 증세가 ㅠㅠ

KLDP 제9회 코드페스트가 진행되는군요. 그런데 이번에는 청주 라마다 호텔에서 ㅋㅋ 지방에서 개최되는군요. 서울에서 셔틀도 움직인다니 꽤 매력적입니다. 여기에서 참가신청하시면 됩니다. 바로 고향집 근처이기 때문에 어차피 주말에 집에 내려가는 김에 참가 한번 해볼랍니다. ^^ 근데 무슨 프로젝트를 진행하나!! 그냥 먹고 놀다 올까봐요 ^^;; 관심있으신 분들은 같이 Taverna plugin 프로젝트 아이디어 좀 내고 같이 open source 프로젝트나 진행해 볼까요 ^^;;

OBF(Open Bioinformatics Foundation)은 바이오인포매틱스분야의 공개 소스 프로그래밍을 지원하는데 초점을 맞추고 자발적으로 운영되는 비영리 단체이다. 이 단체는 자발적인 프로젝트인 Bioperl, BioJava, BioPython에서 생겼고, 하드웨어 소유를 위한 적당한 조건들과 도메인 네임 관리, 컨퍼런스와 워크샵을 위한 기금마련 등을 처리하기 위해 통합되었다. OBF의 주요한 활동은 다음과 같다. BOSC(Bioinformatics Open Source Conference) 컨퍼런스를 승인하고, 개최한다.미래의 ‘hackathon’ 이벤트를 승인하고, 개최한다.서버와 설비, 은행 계정, 도메인 네임과 같은 자산들을 관리한다.미국의 Delaware주에 비영리 법인으로 조직되어 있..

Taverna에서는 자신이 수행한 워크플로우에 대한 내용을 데이터베이스에 기록해 놓을 수 있다. input과 output을 비롯해서 중간에 생성된 결과물까지 몽땅 데이터베이스에 기록해 놓았다가 언제든지 다시 실행해 볼 수 있다. 바로 LogBook이라는 플러그인이 그것을 가능하게 해준다. 위의 그림처럼 자신이 수행한 워크플로우에 대한 모든 내역을 기록하고 다시 꺼내 볼 수 있도록 하고 있다. MySQL 데이터베이스만 설정해 주면 사용준비 끝이다. 자신의 작업 내역을 기록해 보고 싶다면 강력 추천한다. 또 한가지 Taverna에서 Beanshell을 가지고 java 프로그램을 작성할 때 외부의 jar 라이브러리를 불러다가 프로그램을 작성할 수 있는 기능이 있는데, Beanshell의 설정창 맨 마지막 탭을..

현재 KISTI의 Bioworks는 무한한 가능성을 가지고 있음에도 출발부터가 뭔가 잘못되었다는 생각을 떨쳐 버릴수가 없다. 질문해놨으니 뭔가 속시원한 답변이 있겠지. 아래는 질문내용입니다. 로그인부터 시작해서 User Data에서 폴더를 생성하거나 자신의 데이터를 올리거나, 자신이 이미 작성한 워크플로우나 데이터를 선택하려면 너무 오랜 시간이 걸립니다. 제가 보기에는 사용자의 컴퓨터 사양이 문제가 된다는건 말도 안되는 소리입니다. 역시 프로그램의 배포 방식이 문제가 된다는건 말도 안되는 소리입니다. 가장 기초적인 작업 조차도 할 수 없는 상황에서 너무 답답합니다. 배포 방식을 바꾸던지, bioworks에서 자랑하는 사용자 데이터의 서버 저장 방식의 로직을 바꾸던지 뭔가 해결책을 좀 주시죠. 제가 보기에..

곧 터트릴려구요 ^^

갑자기 누군가에게 파일을 줘야할 때 box.net을 사용하도록 합시다!!! 여기를 클릭 하십쇼!!

위의 워크플로우는 input으로 받은 내용을 가지고 c:\perl\example\example.txt라는 파일을 만들고 perl스크립트를 통해서 해당 파일을 읽어서 result로 출력하는 워크플로우이다. 뭐 간단한 것이지만 외부 Perl 프로그램을 수행한다는 점이 주목할만하다. Taverna에 대해 이야기 하다가 가장 많이 듣는 부분이 java로만 프로그래밍 할 수 있나요??라는 부분인데, taverna에서는 외부 커맨드라인 기반 어플리케이션을 수행할 수 있는(즉 perl, python, ruby등등 모두 해당) processor가 존재한다. Available Processor > Local Services > Local Java widgets > io > Execute cmd-line app 프로세서가..

fedex 배송추척 현재 apple store에서 온라인으로 주문한 iphone이 fedex를 통해서 배송중인데, 중국에서부터 알라스카 등등을 거쳐 최종 도착지인 시애틀로 ^^;; 처음엔 중국이라 깜짝 놀랐습니다. 13일날 주문했는데 15일부터 배송을 위한 작업을 진행중이군요. 1-3 business days가 걸린다구 하더니 주문한 날짜부터가 아니라 배송 시작부턴가 보네요.

경진대회 꼭 KOBIC이나 KISTI만 하라는 법 있나요?? 제 1 회 Taverna 경진대회 시작합니다. ^^;; 문제 여기를 누르시거나(마우스 오른쪽 버튼을 눌러서 다른이름으로 저장을 선택해서 저장 ^^) 또는 여기를 누르셔서(myExperiment에 계정을 만들고 로그인하셔야 다운로드 가능) 워크플로우 xml 파일을 다운로드 받으실 수 있고요. 실행해 보면 제 여자친구와 저의 아주 뜨거운 사진을 볼 수 있습니다. 따라서 미성년자는 대회 참가를 허락합니다. ㅎ 얼른 Taverna를 다운받으시고 위의 워크플로우 파일을 실행시켜 보세요. 실행시킨 Taverna결과를 캡쳐해서 보내주시면 됩니다. 상품 추첨하여 소정의 경품(?)을 드리겠습니다. 아직 기념품은 확정되지 않았습니다. 기대해 주세요 ^^;; (경..