바이오인포매틱스 분야에서도 많은 부분에서 컴퓨팅 파워를 필요로 하지만, 그 중에서도 대표적인 부분은 genome comparison과 alignment 일것이다. 이러한 대용량 컴퓨팅 파워에서 그래픽 카드의 비약적인 발전으로 GPU의 그래픽 이외의 계산에 응용되기 시작했다. 그런데 여기서 한가지 짚고 넘어가야 할 것이 있다. 슈퍼컴퓨팅 분야에서 클러스터를 이용한 방법은 비교적 값싼 하드웨어를 통해서 높은 성능을 얻을 수 있다는 장점으로 많이 사용되고 있다. 그러나 각 컴퓨터에 분산된 메모리에 접근해서 사용하기 위해서는 MPI와 같은 라이브러리를 이용해서 병렬 프로그래밍을 해야만 한다. 그래야 분산된 메모리를 마치 하나의 메모리처럼 사용하여 프로그래밍을 할 수 있다. 마찬가지로 GPU의 성능이 아무리 뛰어..